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【国际警察署】
明彦在R事件的犯罪嫌疑人锒铛入狱后，与维卡中止了证人保护计划的合约，用原本的姓名“西蒙·颜”生活。他离开家乡莱姆市，来到了关都地区，为了继续研究超梦细胞而进入富士博士的研究所。他常常在深夜收听业余无线电频道，隔三岔五地听见马睿因在频道中发牢骚，抱怨工作太多。他之前的保护者——国际警察署蒸发密令组组长维卡，为寻找下一个被保护着而不断奔走着。
帅哥的记忆没有恢复。他因为屡次立功而被提拔。他一直难过于搭档不良蛙的死，从未收服新的宝可梦。在成为了国际警察署的一把手后，他和莉拉并肩协作，惩恶扬善，宝可梦世界的恶性犯罪逐年减少。
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【布鲁根】
布鲁根·大江最终没能吞并皇家巨蛋。他曾多次因非法侵占土地被君莎小姐逮捕，但很快被保释出狱。在他的苦心经营下，他的商业帝国逐渐扩大，彩虹快乐开发建设公司成为了阿罗拉地区最大的地产商。他的妻子扶桑做起了全职的家庭主妇，他的母亲安享晚年，一家人偶尔会去丰缘看望小溪。
随着阿罗拉宝可梦联盟落成，每年拉纳基拉山上都举办大会。他的女儿小沐荣获第7届宝可梦联盟的冠军，大江对此欣喜若狂，一掷千金宴请四座岛屿的所有居民。
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【木槿】
大吾结束蜜月后正式继承得文，木槿与秘书黑田道别，正式开启了他期盼已久的退休生活。
退休后的木槿并没有闲在家中，也没有像年轻时那样进山挖石头。他将退休时光投入发明。他在城市和乡野中寻找灵感，创造出无数有趣的小物品。每周的周一、周三和周五，木槿会在卡那兹市的训练家学校门外摆摊，向放学的孩子们展示自己的发明。他用他灵巧的发明为孩子们带去了欢笑。
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【希嘉娜】
陨石危机后，希嘉娜云游四海，学习关于龙系宝可梦的知识，想要以此冲淡对汐嘉娜的思念，从束缚中解脱，寻求新的生活方式。但无论她怎么尝试，她始终无法忘记汐嘉娜的笑容。几年后，她的祖母，也就是流星之里的长老病逝。她返回家乡，成为了流星之里的新任管理者。
她对龙系宝可梦的出色的认知和对战的丰富经验很快让她获得了族人的尊敬。宝可梦联盟邀请她担任龙系天王，但遭到婉拒。
流星之民都说希嘉娜是一位充满智慧的领导人，大胆聪慧，不受世俗情感拘束。可是她自己知道，只有当她在夜晚仰望星空时，她才能暂时放下执念，与浩渺的星空相融。她最终选择与执念共存，终生未婚。临终时她开心地对下一任继承人说：
“太好了，我终于要跨过此岸与彼岸的沟壑了。”
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【皮皮】
有了小溪的房子，皮皮们基地的设施越来越完善，它们建造出了不输人类的宇宙飞船。一百年后，人类正式启动星际殖民计划，飞往太空。之后又过了10年，皮皮们将房屋归还给小溪和大吾的子孙，驾驶飞船，回到了它们心心念念的月球。
为了感谢两位小溪，它们将两位小溪的海报也搬去了月球，并在月球上修建了两尊纪念碑。外交官皮皮皮与赞助人小溪的故事被皮皮们代代流传，大家歌颂皮皮与人类姑娘的友谊。
去到月球的皮皮和地球上的人类和宝可梦一直保持联系。它们也与人类的天文中心保持合作，向人类兜售各种宇航器具。
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【索蓝斯博士】
索蓝斯博士研究大吾拍下的陨石中宝可梦，最终确定它是宇宙病毒DNA变异后产生的宝可梦，它胸前的晶体是它的大脑。这种宝可梦智商很高，擅于控制超能力，他将其命名为“代欧奇希斯”。他推测，代欧奇希斯能变幻不同形态，且每种形态的代欧奇希斯能学习不同的招式。
为了验证这一推测，索蓝斯·高雄将余生精力投入星际殖民计划，培训未来的宇航员跳跳。他期待有朝一日能驾驶太空飞船驶入太空，亲眼目睹这只宝可梦。
在与小溪和大吾的关系上，他很快意识到小溪不懂物理，并不是那位他曾经认识的姑娘。他依旧和小溪以及大吾维持着友谊，绿岭宇宙中心也和得文保持合作。他至死也没有参透“小溪”曾经说过的那句“出远门”是什么意思，不过他已经不在意了。每个人总有自己想去或是必须去的地方，就像他想去宇宙遨游一样，那位小溪或许也有不得不去的地方和不得不完成的心愿吧。
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【小遥和小悠】
小遥和小悠相互扶持，共同旅行、成长。小遥依靠主力火焰鸡，在几年后的彩幽大会中夺冠；小悠以协调训练家为目标，得到了华丽大赛的冠军。两人虽然时常吵架拌嘴，但是感情却因此变得更深。在二人成年的那一年，两人同时像对方告白，又经过了几年的交往，两人携手踏入婚姻的殿堂。
由于两人在旅行中广泛结交朋友，因此婚礼现场非常热闹，小溪和大吾也受邀前往参加。作为丰缘新一代训练家的代表人物，两人得到了前任冠军的诚挚祝福。
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【海洋队和熔岩队】
海洋队和熔岩队在陨石危机中立下汗马功劳，得到了联盟的嘉奖，但他们却因为协助弗拉达利毁灭世界被重新调查。
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