波尼岛的卡璞·鳍鳍任命哈普乌为岛屿女王。她是波尼岛前任岛屿之王的孙女，全家在岛上经营着一家波尼萝卜种植园。
四位岛屿之王和岛屿女王齐心协力，阿罗拉变成了人类和宝可梦快乐生活的乐园。有关神的传说逐渐被人忘却，人类和宝可梦主宰着自己的命运。
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【古兹马】
战后古兹马再次向露莎米奈表白，却又再次被露莎米奈拒绝。露莎米奈欣赏他的才华，对他并无暧/昧，鼓励他寻找新的人生目标。
情场和事业双失意的古兹马在阿罗拉各处流浪。在美乐美乐岛，他遇见了以前的师傅哈拉。哈拉收留了他，重新成为他的师傅，将古兹马培养为在阿罗拉对战树工作的优秀虫属性训练家。古兹马一直维持单身，在参加了露莎米奈和莫恩的婚礼后，这才开始了人生的第一场恋爱。
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【马睿因和马玛内】
马睿因继续担任辉克拉尼天文台台长，将科研重心转入探索外太空。之后他代替哈拉成为联盟四天王，在工作空闲之余接受训练家的挑战。
使用业余无线电的人越来越少，当他打开电台，无论如何呼叫，广播中都只有沉默。马睿因一直坚持使用业余无线电，他每晚在频道中总结工作，就算晚年缠绵病榻时依旧如此。他离世后，再无人使用业务无线电，一个时代就此终结。
马玛内从宝可梦学校毕业，先后在辉克拉尼天文台、以太基金会和Pokehub担任工程师。之后他获得了得文公司和以太基金会的投资，在阿罗拉创立园庆广场，为来自世界各地的训练家提供交流的平台。广场出售得文的产品，为宝可梦提供按摩、装扮等服务，受到训练家的好评。
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【阿塞萝拉】
阿塞萝拉本想安安静静地在图书馆工作，库库伊博士发掘了她的潜力，招募她为联盟的四天王之一。贪心拉普凭借自己傲人的体型，一次次吓退了前来挑战的训练家。她鬼系宝可梦的实力被阿罗拉的训练家口耳相传，大众一度相信她是一位巫女。
她爱好读书，假日常常窝在自家的图书馆。她通过阅读知晓了阿罗拉的真实历史。那一夜，她带着幽灵系宝可梦来到树林间，点燃篝火，祭奠光辉大神。
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【跳跳】
回到丰缘后，每个工作日的早晨，梦幻和大吾、小溪同时出门，去绿岭宇宙中心参加航天培训。工作之余它通过手游放松，它的工资大部分被拿去氪金了。
它和兹伏奇一家快乐地生活着，见证了孩子们的诞生、成长。它与小溪的牵绊也越来越深，虽然它一直用“小猴儿”称呼小溪，但它和小溪之间的友谊早已不输于它和溪丫头的友谊了。
一百年后，宇宙探索殖民计划初具雏形，各地区的航天局向全世界招募第一批移民。经过层层筛选，梦幻和被选中的另外九名人类正式成为宇航员，在阿罗拉的哈伊纳沙漠参加为期五年的封闭培训。由于小溪和大吾均已离世，了无牵挂的梦幻穿着印有阿罗拉旗帜的宇航服，在人类和宝可梦的祝福下，搭上载人航天飞船，飞往了距离地球最近的那颗行星。它和其余宇航员一道建设殖民地。
又过去了一千年，经过梦幻和一代代殖民者的辛勤劳作，该行星发展壮大，人口日益增长。这颗星球成为了人类和宝可梦的新家园，人们甚至在那里也建成了宝可梦联盟。以探索宇宙、寻找创世神为目标的梦幻再度踏上新的征途。
它从皮皮那儿购买了航天飞船，与殖民地的朋友们道别。在一个繁星漫天的夜晚，梦幻头戴小溪曾送给它的、已经褪色了的缎带，向星星许下心愿后，驾驶航天器飞入宇宙深处。它要穿过星星的帷幕，去寻找宇宙的终极答案。
它寻找了三千年，经过它的不懈努力，它终于见到了阿尔宙斯。它忐忑地站在这位人类公认的“创世神”面前，开口询问它宇宙的真理。阿尔宙斯没有回答它，它与梦幻对战，梦幻轻而易举地战胜了它。阿尔宙斯缓缓化成了灰烬，在梦幻眼前消失。
“任何生物在活了太久之后都会发疯，我也不例外，谢谢你将我从我的疯狂中拯救出来。”在彻底消失前，阿尔宙斯说，“我确实是你们口中的‘创世神’，‘创世’是我的创造者为我书写的意义，我没有见过我的创造者。祝你好运，穿梭于星空的探险家。”
梦幻重振旗鼓，继续搜寻。偶尔它当怀念起地球的草木时，它会回到地球小作休息。每次当它返航时，AZ和花叶蒂总会外出迎接。
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【宝可梦们】
百变怪、熔岩蜗牛在小溪的照顾下成长，在大吾的训练下变强。它们成为了同辈宝可梦的楷模，经常在联盟的表演赛中作为大吾的宝可梦登场。
九尾和穿山王也愈发厉害，穿山王一度成为了大吾的主力宝可梦之一。十几年后它们陪小溪和大吾的孩子踏上旅途。在穿山王死后，九尾告别了训练家，返回拉纳基拉山，成为了雪山的守护神。
智挥猩帮助小溪照看孩子，直到孩子们全部成家立业。它回到了树荫丛林。这是它和小溪相遇的地方，它过去因为认可小溪的智商而被甘愿被小溪收服。在回到家乡后，它开办了一家森林咖啡厅，咖啡厅的甜点配方是它和小溪过去一起发明的。卡璞·鸣鸣是咖啡厅的常客。
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