于是喷子先生努力安下心来继续等了半个月，仍旧没有等来商九辕或何以居，忍不住再次询问看守人员，看守人员告诉他，指挥官和指挥官又出去度蜜月了。
喷子先生“……”
看守人员继续安慰：“不用担心，没人提醒的话，指挥官这辈子都不会想起来的，所以你就安心的在牢房里渡过余生吧。”
喷子先生并不安心，他总想着搞事，他坚定的告诉自己，这只不过是商九辕，何以居在同自己打心理战，自己不能认输。直到几年之后，喷子先生嚎啕大哭，终于认识到当初的自己还是太年轻。
这边，商九辕与何以居如约前往母河海底探望双子星河，乘坐潜水艇，两人很快来到了海底基地，从那里，两人得知了两只企鹅仔的真实身份。为了维持生态球最初的生态稳定，安LAN人创造了三个管理者，最高级别的管理者就是双子星河，他生活在南北交界处，负责管理中部大循环。
另外两个管理者分别管理南北两半球，管理两半球无法移动的主框架，维持生态平衡和稳定。对照三个管理者，分别建造了三个基地，即海底基地，南北两基地。
但是还没等把两只企鹅仔送到南北两基地，生态球就遭遇了入侵者攻击，所有智慧生命全部通过次元门前往了地表，于是企鹅仔就陪着双子星河留在了海底基地。
双子星河还说，小企鹅可以感受他人心中善恶，从而判断南北半球生活的生命，避免出现极端破坏者，两只企鹅仔不单单是钥匙，更是管理者和平衡者。
听到这里，何以居想起了不久前阳春说过似乎见过小企鹅的话，而阳春身为山神，同样拥有感知他人善恶的能力。也许，白鹿山能转换时空来到这里，并不是偶然。
这一次，两人在海底基地停留了略长的时间，七天之后才重新返程。双子星河送别了两人，依旧是那副不谙世事的样子，依旧执着的等待着00931舰队和舰队队长。
回程中再次路过那只巨大的章鱼化石，商九辕不知突然想到了什么，却什么都没说，只是将何以居送回了基地，并且煮了很多很多白菜鱿，然后连续几天种了一大片小白菜，确定白菜苗冒芽之后，又给了何以居一枚空间戒指，“蜗蜗，我出门一段时间，你的壳要留在基地不方面移动，出门的时候物资就暂时放在戒指里吧。”
何以居拿着戒指，询问道：“君君什么时候回来？”
“很快。”说着闻了闻何以居的额头，又亲了亲何以居的嘴唇，这才离开。
只是何以居没想到，这个很快其实一点都不快，当冬雪再一次覆盖暗黑大陆，何以居意识到了什么。
总基地众人就只能这么无力的看着自家指挥官一天比一天沉默，一天比一天站在基地门口的时间长。
商九辕失踪之后，何以居的生活变得无比规律，似乎他曾经也这样渡过了很长一段时间。只是他每天都会在基地门前等很久，希望能看到商九辕回来的身影。
第二年春天，总基地开始飞速发展，小型城池最终在这一年变成了大型城池，系统科技与安LAN科技的碰撞融合开辟了另一条全新的科技线。AI甚至都在PDK的帮助下有了身体，可以离开北部基地，并且也在逐步觉醒智慧。
在暗黑大陆这个特殊的环境之下，多种文明和科技的碰撞，让暗黑大陆走出了一条截然不同的路。
超级感染体的数量越来越多，但何以居的科技已经开始向外辐射，除了定期清理变异体和超级感染体的小队，从总基地流出的大量新型武器开始在暗黑大陆流通。
奇迹商队赚的盆满钵满，当然，何以居自己的商队也发展的非常不错。在这一年的秋季，何以居解锁了指挥中心的天赋，并且成功建造了第一个指挥中心，拿回了自己的充当指挥中心的壳。
何以居再次成为了一只有壳的蜗牛，摸着手上的空间戒指，低低叹息了一声。
这一年的冬季，总基地的居民有些炸锅了，因为他们的第二个指挥官也失踪了，当然，何以居离开之前留了信件，并且带走了【科技发展基地】建造的深海潜艇。
众人猜测他可能去了母河，只只是凛冬将至，他们不能离开去寻找，更何况他们还要再建造一艘潜水艇。
何以居虽然离开了基地，但新建造的指挥中心已经让基地完全可以自由发展。这大概就是基地发展到最终的模样，指挥官只是基地的引导者，并非领导者和掌控者，当有一天基地真的独立生存在暗黑大陆，那大概就意味着，指挥官的任务结束了。
至于何以居，则顶着风雪来到了母河，母河的河水格外冰冷，何以居还是走了进去，等走到足够深度便放出了潜水艇。在企鹅仔的帮助下设定航线，而目标就是巨型章鱼化石所在的那个无底悬崖。
“仔仔，爸爸带你去找另一个爸爸，然后罚他种一辈子白菜！”何以居摸着小企鹅的脑袋，小企鹅用翅膀抱住了何以居的手，回以安慰。
潜艇沿着海底裂缝，渐渐隐没在黑暗之中，沿着巨大的章鱼触角化石，何以居完全不担心迷路。再一次停留在巨大章鱼化石的附近，感受着深海巨兽的庞大。这只作为框架支撑的庞大生物，静静沉睡在深海悬崖的边沿，一半在深渊，一半在海底。
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