时间所剩无几，陈文决定趁着这段时间的空档尽可能的强化自身的军事实力。
陈文离开大军的这半个月，吴登科率领义乌营和半个东阳营守卫龙游县城，李瑞鑫带着南塘营屯集于南部的山区以为奇兵，而楼继业则带着参谋人员和水营以及部分随军而来的后备兵员扼守灵溪防线，同时协调吴、李两个总兵进行防御作战。
短短半个月的时间，看起来似乎这三个武将彼此之间协调的还算不错，但是随着军法官们的报告送到陈文的案头，陈文却发现事实远没有他想象的那么乐观。
陈文留下楼继业进行协调，用意在于强化参谋长制度的权威，以便于将这项近代军事制度在营一级进行普及。但是陈文离开口，吴登科和李瑞鑫为了更方便两支重兵集团间的联络，干脆直接以探马互通有无，只是将彼此获取到的情报和对于战局的分析送一份给楼继业了事，似乎是把总参谋长当成了负责备份文件的吏员。
这个问题现在还没有造成什么明面的损失，那是因为吴登科和李瑞鑫二人都是最早那批追随陈文的武将，彼此之间的关系也很不错，而楼继业只能却算是后进，又领了这么一个职务，权威性在他们看来自然要低上一些了。
军中的关系最重要的应该是阶级、差遣，而非派系和交情，这是陈文始终坚信的真理。在他的记忆中，共和国成立前的最后一个对手便是倒在了自身的内耗之中，而且还是在原本拥有极大优势的情况下短短几年时间就被彻底推翻。而共和国最初的那支钢铁雄狮，虽然内部也并非没有派系，但是在同一面旗帜下却能够彼此无间的协同作战。
陈文这支军队成立的时间日短，部将之中虽然也并非没有拉帮结派的现象，例如一些曾经的上司和部下之间的关系显然要更好一些，但还远远没有发展到形成真正意义上的派系的程度。
这个潜在的问题想要彻底根除是根本不可能的，但是减少因为派系造成的内耗而导致过大的损失发生，这还是可以做到的。只不过，现在还不是时间，所以陈文决定暂且不动声色。
除了这个问题，在南塘营强渡灵溪直到现在，陈文重新审视了他设计的那个锯齿阵，发现了其中存在着致命的问题，那就是一旦士卒损失过大，阵型根本没有自我恢复的能力。而阵型遭到了破坏，就意味着军队即将崩溃。
这个问题在强渡灵溪时表现得并不是很明显，主要是因为明军身处死地，一旦战败士卒们几乎很难活着逃离战场，还有就是地形的口子被明军扼守，督标营无法发挥兵力优势。这些对于清军来说并非没有办法解决，因为双方的兵力差距实在不小，车轮战完全可以把得不到替换的明军步兵拖垮。
若非李瑞鑫灵机一动的抽调了两门佛郎机炮加速了清军的崩溃，使其没有机会进行轮换的话，最终取得胜利的很可能是清军的督标营而非明军的南塘营。
之所以会出现这种问题主要还是因为他太过于迷信灵活的鸳鸯阵，却忽视了清军的应对。当下面对浙江清军，他的军阵缺乏的是厚重和密集，鸳鸯阵在局部密集方面很好，但是由于强调灵活的关系，厚重就显得不足了。
戚继光的办法是用车炮营来构建起临时的“城墙”，依仗火器来打散对手的军阵，再以骑兵和步兵突击，但是陈文面对的清军拥有大量的火炮，在坦克出现前，最好的办法还是依仗工事和士兵坚定的意志来进行防御、进攻，所以军阵就必须厚重起来，尤其是阵型的中部。而他则是在组建长枪阵杀手队的同时并没有发挥出其厚重的特长，还是过分依靠灵活的鸳鸯阵杀手队和火器队发起进攻，所以才会导致了现在两边都无法达成效果的尴尬处境。
既然如此，陈文打算将战兵营进行重新整编，所有长枪阵杀手队统一编入各营的第一局和第二局，鸳鸯阵杀手队则统一编入第三局和第四局。列阵时以厚重的长枪阵杀手队坐镇中军，灵活的鸳鸯阵杀手队扼守侧后，同时作为预备队存在，交战时按照情况通过变阵来进行调动，想来应该比现在有些不伦不类的锯齿阵要强。
阵法的修改，需要时间和训练进行磨合、适应，必须立刻开始改编。既然清军暂时避战，原本只对义乌营进行改编的陈文决定利用这段时间来分批次进行改编，其中各站兵营还要轮换回返金华府。除了补充外，那里还有更重要的事情需要战兵营的军官士卒们参与其间。
巡视了数日，陈文便回到了金华府城，而第一批轮换的部队则按照负责参谋们设计的时间表的安排进行。
没过数日，陈文便再度回到了府城，很是出乎金华府官吏士绅们的意料，不过听闻了清军暂时撤军的消息，一个个在稍微震惊了片刻后就连忙前来恭维陈文“虎威”震慑敌胆，陈锦摄于陈文之威连对战的勇气都没有。更有甚者还一口咬定别说是陈锦了，就算是金砺来了也是一样，不过却还是没人敢说满八旗军会害怕陈文，毕竟大伙都是文化人，拍马屁也要懂得分寸的说。
只不过，陈文对于这些恭维连给个耳朵的兴趣也没有。回到了府城，陈文便急匆匆的赶去军工司的作坊。
所谓军工司，就是原来的军器司，更遥远的大兰山营造司。陈文在平定叛乱后，军器司的文官小吏被清洗一空，工匠们迎来了新一批的领导，在得到陈文的许可后也把牌子换成了军工司，为的是和那些叛逆划清界限。
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