T机关的第十六局是内部安全局。这个局在T机关内部不太招人喜欢，这与它的任务是有关系的。它主要负责T机关的内部安全，包括录用特工人员时的背景审查，机关大楼和重要领导的安全，检查特工人员是否遵守保密规定，定期对特工人员进行测谎，监视T机关特工人员并找出其中可能存在的叛徒，它就是一个T机关内部的T机关，是监视其他特工人员的特工人员，所以自然不招人喜欢了。
第十七局是机要局。这个也不用多说了吧？它主要负责密码通信业务，和别的政府机关的机要部门基本上一样，但T机关作为一个特工机关，它的机要局还是有一些其他部门的机要局所没有的职能的，但这个是不能说出来的。
第十八局是警卫局。T机关的警卫局可不是为什么VIP提供人身保护的，而是和美国的U。S。Marshal有点类似的，是从事秘密人身保护的单位。假设有外国情报官员叛逃到中国，如果是由T机关负责此人的话，那么T机关就会为他提供安全保障，包括给他提供新的名字和身份，给他安排工作和住房，他的安全也就由警卫局来负责了。有时，如果有别的部门的特工人员在执行任务时觉得可能会遇到危险，比如情报局的某名特工将到国外某危险地区运送情报的话，为了保证人员和情报的安全，可以向警卫局申请，被批准后由警卫局派人专门保护这名特工人员秘密完成任务。此外，警卫局也要充当看守的角色，如果T机关抓获了外国特工人员，则这名被秘密囚禁的外国特工便要由警卫局来负责看押。
第十九局是老干部局。这个也不用介绍了吧？
第二十局和上述的业务局并列也显得牵强，因为它是政治部。这个政治部当然就和以前香港警察的那个“政治部”（SpecialBranch）是完全两回事了，它平时主要是做一些思想政治方面的宣传与教育工作。
介绍完了这二十个局级机构，还剩下两个由T机关直属的大队，即直属行动大队和直属飞行大队。它们虽然名为大队，但实际却都是副局级机构。
直属行动大队前面已经多次提到过了，主要由退役军人组成。分到T机关来的转业军官基本上都被分到了这里，很少有被分到常规特工业务部门的——这也是考虑到了军人的特点。在军队中对情报感兴趣的人比较少，这一点和我前面提到过的情报在军队中的次要地位是有直接关系的。在军队中，如果一名军官去了情报部工作，这就意味着他在仕途上一般不会有什么前途了，因为情报不是正统军事业务，和打仗是两回事，所以情报军官自然也当不了什么高级指挥官了，用台湾军情局内部常说的一句话讲，就叫“中校军衔扛到死”，毕竟情报不是军队的主业。
而在行动大队这样一个基本上和情报扯不上什么关系的作战性质的部门，军人们则可以继续自己的老本行——他们都是从相应的特殊部队招来的。如行动大队的蛙人中队的人大多来自海军陆战队，以两栖侦察队员居多，不过也有陆军特种大队的。伞降中队的人员多数来自空降兵，也是以空降兵特种大队的居多，个别的也是来自陆军特种大队。这样一来，他们就可以在行动大队继续练习与自己在军队时的专业极其对口的科目了。
除了蛙人中队和伞降中队外，行动大队还有一个狙击中队，一个爆破中队和一个机降中队，其中机降中队兼任地面突击中队，因为他们主要是利用滑索从直升机上机降的，机降的目的自然是在地面进行突击了，所以机降中队也就是整个行动大队中战备最高的机动突击队了，因为除了需要两栖突击或伞降突击等特殊技能的突击情况外，其他所有普通的突击技能都是这个中队的特长。这些中队的人多数来自陆军的特种大队和侦察分队，也有的来自武警的机动分队、特勤分队和特警分队等。但总的来说，因其存在的目的，行动大队练习的主要还是对外特种作战性质的技能，如两栖渗透，空降渗透等，如果T机关要在危机时期以武力突袭敌对国家或恐怖分子运送导弹的船支的话，自然需要具备这样技能的队伍了。也就是说，行动大队的训练科目倾向于国防作战的性质，反恐怖的作用相对弱化，因为反恐怖方面的战术行动是由反恐局战术大队负责的。如果把行动大队比成解放军中的特种兵的话，那么反恐局的战术大队则相当于武警部队中的特警了。由此，两者在训练科目上也多有不同。
最后一个要介绍的就是直属飞行大队了。它和行动大队一样，不归上述的二十个局中的任何一个领导，而直接隶属于T机关。飞行大队的飞机以直升机为主，还有一些特种侦察机，当然，也有无人机和滑翔机。它的主要任务是在空中对地面目标进行跟踪监视，为战术部门提供空中运送（特别是为行动大队的机降中队），在危机时期利用无人机等进行侦察，等等。
在平时，上述的各种任务中最重要，最多见的就是在空中对地面目标进行跟踪监视了，这比起普通的地面监视要有很多优势，而且也隐蔽得多。如果用飞机在空中对地面上外国间谍驾驶的汽车进行监视的话，则被监视者很难在开车时注意到天空中是否有飞机，而且也很难确定该飞机是否是在对他进行监视。
但不要以为有了空中监视就可以放弃地面监视了，这么想的话你可就错了，因为空中监视并不是万能的，在很多情况下飞机是起不到作用的。举个例子：在用直升飞机对在地面上行驶的一辆汽车进行跟踪时，如果开车的间谍是个老手，他完全可以把车开到国际机场，而机场上空是不允许直升飞机飞行的，那样一来他便脱离你的监视了，然后他完全可以在机场里下车，换车，打车或干脆步行离开你的监视范围。所以，在进行空中监视的同时，一定也要有到位的地面监视。
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