布吕歇尔带着14000人冲出城去。傍晚时分，在卢卑克近郊的平原上，布吕歇尔及其队伍被法军团团围住，只得放下武器投降了。
在法军的严厉打击下，普鲁士到处笼罩着绝望和沮丧，许多强大的城堡不加任何抵抗，就惊恐万状地投降了。马格德堡是普鲁士最后一个尚未投降的要塞，11月8日，克莱斯特将军带领全部守军向法军投降，这个号称第一流的强大要塞落入法军手中。至此，普鲁士战役全部结束，几乎所有普鲁士城市都在法国当局的控制之下。
拿破仑从来没有像现在这样得意过。以弗里德里希大王的尚武精神培养起来的普鲁士军队，自诩为欧洲最强大的军队，被他打得落花流水。在短短的一个月以内，作为欧洲四大国之一的普鲁士消失了，整个欧洲为之震惊，德意志各小国更是惊恐万状，他们赶忙派人到波茨坦宫向拿破仑表示归顺。他们跪拜在他的面前，祈求宽恕和庇护；他们向他阿谀奉承，保证自己对他的忠诚之心。拿破仑陶醉在胜利之中，似乎整个世界已踩在他的脚下。
普鲁士国王、路易莎王后以及他们的小朝廷极可怜地在其他地方流浪之后，躲藏到普鲁士王国边境小城美默尔城。普王没料到他的各邦在这么短的时间里都落入拿破仑之手，很后悔发动这场战争。他致书拿破仑请求休战，拿破仑回答说：“太晚了！但是不要紧，我希望停止继续流血，准备听取不至于损害这个国家的荣誉和利益的任何条件。"他召来了迪罗克将军，告诉他：”代表我看望每一个伤兵，发给他们需要的一切慰问品。然后去找普鲁士国王，如果他提出合理的建议就报告我。“
于是，普法双方开始谈判。拿破仑提出：将易北河以西的地方全部割让给法国；普鲁士赔偿军费1亿法郎；承认萨克森及易北河以西的德意志诸邦加入"莱茵同盟"；普鲁士将华沙、波森交还给法国等。后来又提出将但泽等9个要塞让与法国。尽管条件很苛刻，但因普军已溃散，普王只好在11月6日暂时承诺了这些条件。
拿破仑被战争的胜利捧到了不可一世的地位，自我意志无限扩张，谋求新的胜利、新的荣誉、新的权力、新的空间已成为他生命中不可缺少的一部分。他决定要给英国以致命的打击，1806年11月22日，拿破仑在柏林颁布了著名的“大陆封锁令"，强迫整个大陆屈从自己的意志，同英国在经济上打一场殊死战。
外交大臣塔列兰被召到波茨坦宫谒见皇帝，皇帝命令他立即向一切附庸国或半附庸国发出"大陆封锁令".这一法令宣布英国各岛处于被封锁状态，禁止欧洲大陆各国同它们有任何通商往来；法国及其盟国军队不论在何处发现英国货物和臣民，将分别予以没收和监禁；任何违反此令的船只，都将作为战利品加以扣留。总之，凡是法国势力所及之处，都不得同英国有任何交往，否则都被认为是犯罪，是对拿破仑尊严的背叛。拿破仑命令元帅们尽可能逐步完全地占领北海和波罗的海沿岸地方，在那里派上法国税吏和宪兵，以杜绝和消灭走私行为。
欧洲以沉默的、恐惧的顺从态度接受了封锁法令。这一法令暂时斩断了英国和欧洲的联系，这对一直用别人的手发动一次又一次反法联盟的英国是一次极为沉重的打击。英国还从来没有同如此强大的对手较量过，它的英镑暂时失去了作用，它唆使别人为自己火中取栗的政策暂时失去了活动场所，英国第一次面临着整个欧洲大陆的挑战。这是一次殊死的搏斗，英国为了摆脱困境，又一次去找它的盟友俄国，告诉亚历山大，如果他再恢复同拿破仑的斗争以拯救普鲁士，英国将给予他财政上的支持。英国也去找了奥国，但奥国仍对奥斯特里茨战役中的惨败心有余悸，而且奥国也极愿意看到普鲁士的毁灭，因为普鲁士在1805年没有参加第三次反法联盟。尽管奥国在犹豫不决，但在彼得堡，英国如愿以偿了。
11月21日，普王在奥斯泰罗德召开御前会议，讨论和约之事。会上意见分歧极大，斯坦因、福克斯和贝米等重臣坚决反对这些丧权辱国的条件，而主和派豪格维茨等则主张忍让。正在争论之时，传来消息说英国已说服俄国帮助普鲁士对付法国，俄国军队已在西进之中。普王精神为之一振，决定拿起武器再战，以雪亡国之耻。
12月1日，普王下诏整顿军队，严惩失职将领。什切青、马格德堡等要塞守将，因不战而降，被撤职查办；作战不力而降、临阵脱逃者也处以严刑；英格尔里本因弃守库斯特林而被处死。普鲁士军民激于覆军亡国之痛，也都愿意武装再战。
法国派往各国的间谍很快将英俄谈判的情况报告给了拿破仑皇帝。拿破仑一面实施大陆封锁的各种措施，一面征召军队，准备将俄国军队消灭在西进途中。
波兰战役俄国急于报奥斯特里茨失败之仇，15万人的军队开进波兰，气势汹汹地朝法军旗去。
拿破仑也不示弱，立即发出向东挺进的命令，他要在即将到来的冬季里给俄军以打击。他认为不能等待春天再行动，届时俄国人将会集中一支巨大的兵力，而且奥国也可能会被诱惑加入他们的阵营。然而，在严寒的冬季，与尚不知其实力与潜力的俄军交战无疑是一次艰巨而冒险的行动。法国大军团共14万人，要前进1000里去打一场艰苦的战役，不仅要供应军粮，而且还要重新装备过冬用具和补给冬衣，同时所经过的地区都是些森林、沼泽等人口稀少的地带。不过，这些并难不住拿破仑，耶拿战役之后，他曾发布一道命令，规定了柏林城以及其鲁士各附庸所应进贡的物品及数量。这时，各普鲁士城市奉命制造28万件大衣和25万双军靴，还要组成6座总医院，包括一个专门治疗性病的医院在内。柏林要制造60 00床医院床垫和9000件医院床单。
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