早在圣星人的月球大飞船刚来到地球附近时，由于受飞船引力影响，一些体型最大的物种包括一部分恐龙因为适应不了突如其来的小引力灭亡了一部分。体型较小的恐龙的数量在随后的多少万年里也在不断减少，原因有三：一是圣星人一直用光明科技改装恐龙肉体部件延续生命，他们称自己为光明圣星人。二是圣星人收割了一部分恐龙进行分解成为“造人”的材料进行储备和“造人”。三是被地面的“凡人”猎杀捕食。但恐龙的大规模灭绝并不是上面的三个原因，下面要提到真正的原因。
多少万年过去了，在火星上和月球上的圣星人通过无人卫星观测了这场华丽的天体大碰撞，大量的星体小碎块散落在圣星原先的轨道成为了今天地球人所看到的小行星，大块星体碎块有些掠过太阳飞向无穷宇宙有些则冲入太阳进行剧烈的焚烧。nibiru星的星体比圣星大得多，只撞毁了一部分，剩余的绝大部分运行速度有所减慢，还是沿原先的轨道绕过太阳后又飞走了，并没有给地球和火星带来巨大的麻烦。但还是有一些意外的事，有一部分大大小小的星体碎块并没有在太阳中完全燃烧，这些炽热星体碎块从太阳里面冲出来直冲地球。有些掠过地球飞走了，也有九个较大的被地球引力捕获运行于月球轨道之下（这些后来所谓的金乌轨道高度为2万公里左右），还有大量的热星体碎块燃烧着冲入地球上的大海中，巨大的冲击引发了大规模的海啸，大量的海水涌上陆地，大量的烟尘、气雾迷漫在地球上空遮天蔽日，剧烈的燃烧使地表空气中的氧气含量降低，另外再加上星体爆炸的巨大冲击波和碎块冲撞使地球表面微微震动，恐龙是冷血（变温）动物，受不了剧烈的环境变动带来的折磨很快灭亡了。地面上的凡人种群也灭亡了，但绝大多数鸟类和哺乳动物却存活了下来，圣星人从这一事件中受到启发和提示，再次造人的时候就修正了人类的DNA使人类变为温血（恒温）动物。
这场灾难引发了猛烈的太阳风暴，巨大的“风眼”在太阳表面肆虐并向外不断喷发。也使光明圣星人的通讯及导航设备受到了巨大的破坏。本来月球设定的自转角速度等于公转角速度，月球自转周期与公转周期则是完全相同的，即都是27.32166地球日（27日7时43分11秒），月球公转一圈的同时只自转了一圈，这样的结果是使月球总是以正面对着地球的远古大陆进行同步自转。但太阳风暴使月球使去大部分动力不再绕地球公转，只是被地球引力拖拉着和地球一起绕太阳公转。太阳和地球附近的九个炽热火球的光和热促使地球的远古大陆很快又焕发了生机。
光明圣星人只等月球动力设备恢复以后，运输系统就可以再次启动为月球增加资源和能源，同时月球也必须抽时间重新定位轨道，因为月球的体积和质量会不断增加，月球的引力也必然会加大，和地球引力互相吸引会发生事故。圣星人计划的首次重新定位轨道的项目代号叫“天地分离”，21世纪有的人类银行曾经有个山寨系统项目代号叫“天地对接”。在后来盘古的神话里“天日高一丈”，而且刚刚分离的“天空”几次想降下来与大地重合，摇摇欲坠。所以月球必须在一个时间果断的远离地球，否则就会和地球撞在一起。后话不表。因为这个天地分离的计划被一场和火星圣星人的战争打乱了。
天体冲撞的时候，火星离太阳较远，上面的圣星人一直在火星的地下生活。他们的科技设备则只受到一些轻微伤害，他们的天空中反而还多了两个来自故乡的美丽的“卫星”，这是火星引力捕获的圣星碎块，后世的地球人把他们叫火卫一、火卫二。不知又是多少万年过去了，在太阳光的照耀下，地球表面又富有了生气，疾风劲吹、江水奔流、花开果熟，各类生物又开始生生不息，地球靠优秀的自我净化功能又恢复了勃勃生机。
而火星的情况却很糟糕，那里的资源消耗很快，因为早先移民火星的圣星人比移民地球的圣星人的数量要多很多，而火星的体积、资源容量比地球要小。由于通讯一直联络不上，火星上的圣星人认为地球附近的圣星人已经随着恐龙一起灭亡了，所以火星圣星人自己推举了一个领袖叫做蚩尤。蚩尤是火星圣星人后代中最顶尖科学家，他把光明的科技文明转变成黑暗的魔性文明，称自己为黑暗圣星人领袖，并命令所有的黑暗圣星人去恢复生机的地球寻找各类资源和能源。蚩尤的舰队在远古大陆上空发现了光明圣星人在圣帝尊的领导下仍活跃在巨大的月球飞船里，但这时黑暗圣星人疯狂的认为脱胎换骨的光明圣星人已经不是纯净的圣星人了，黑暗圣星人想要消灭光明圣星人然后霸占地球。
光明科技与黑暗魔法的史前大战在地球的外层空间开始了。光明圣星人的星系定位系统（类似于今天地球人的全球定位系统）由于在星体大冲撞时受损，所以一开始处于下风，他们的“指南车”（神话传说中星系定位系统的别名）修好后扭转了战局，最终结局地球人都知道，邪不胜正（详见《圣帝尊》外传《文明之殇》第一回《火星文明》和资料片《对话录》第六回《密电原文》）。
此刻光明圣星人的最新医学科技已经可以自由存取生物大脑的记忆信息，在擒贼擒王之后，“寇首”蚩尤的脑信息被圣帝尊命令银针封印禁锢到哺乳动物“狼”的大脑里。其他的黑暗圣星人见罢“杀一儆百”、“杀鸡给猴看”的表演，吓的纷纷：
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