社论强调，对蔡元培的纪念，“应当继承蔡先生的学术研究自由、信仰自由的精神，对青年学子的学术研究予以启发扶助，对青年思想信仰，予以自由发展的机会”。若再进一步分析，《新华日报》此篇社论以“自由”为主题立论或有强调“选择的自由”之意。此时国共两党正处于意识形态斗争的关键时期。而此篇社论的倒数第二段“插入”了中共关于知识分子政策的解释，甚至还特意以放大一号的黑体字置于报头右侧再次予以强调，正可说明其社论确有“言外之意”。社论有言：
我们，共产党人，固然始终为劳动群众利益而奋斗，可是我们是一向尊重和爱护一切先进的知识分子；我们认为一切知识分子的真正出路，只有与广大劳动人民携手，为广大劳动人民服务，才能得到自己真正的发展和出路！
从基本的行文规则来看，此段文字的讨论与整篇社论“自由”的主题似乎并不完全对应，甚至可以说有些突兀。不过，若联想到此前中共对知识分子政策的变化，便也不难理解社论所欲言的“言外之意”。
1939年10月，身在延安的艾思奇便发表了《共产党与知识分子》一文，提出党在知识分子问题上重要的任务之一即是“要善于吸收革命的知识分子到自己的队伍中来”。[108]1939年12月1日，中共中央正式做出了《关于大量吸收知识分子的决定》，提醒党员要“严重地注意这个问题”，并且将其上升至“是革命胜利的重要条件之一”的高度。毛泽东表示要大量吸收知识分子，特别是在当前严酷的斗争之中，“共产党必须善于吸收知识分子，才能组织伟大的抗战力量，组织千百万农民群众，发展革命的文化运动和发展革命的统一战线。没有知识分子的参加，革命的胜利是不可能的”。[109]12月9日“一二·九”运动纪念当日，毛泽东再次论述了共产党与青年学生、知识分子之间的天然联系。他表示：“共产党从诞生之日起，就是同青年学生、知识分子结合在一起的；同样，青年学生、知识分子也只有跟共产党在一起，才能走上正确的道路。知识分子不跟工人、农民结合，就不会有巨大的力量，是干不成大事业的；同样，在革命队伍里要是没有知识分子，那也是干不成大事业的。”[110]
知识分子政策的变化，是中国共产党根据革命斗争形势而做出的积极判断和调整。在此种历史语境下展开的对蔡元培的纪念，也带有现实政治的深刻痕迹。从纪念活动的实际影响来看，中国共产党经由对蔡元培与“五四运动”之间关系的诠释，既表达了中共对领导五四新文化运动先贤逝去的哀思，也借由蔡元培在青年学生与知识分子中间毋庸置疑的号召力，适时配合了中共知识分子政策的宣传。
1940年4月14日，延安各界又特意在中央大礼堂举行了追悼蔡元培、吴承仕大会。到会者有吴玉章、艾思奇、范文澜、丁玲等文化界的代表，另有延安各机关团体及学校代表，共千余人。会场布置极为哀穆，悬挂各方送来之挽联、花圈。大会首先由吴玉章报告此次追悼会的意义，接着全体肃立默哀三分钟，继由范文澜简略报告蔡元培生平，并由文化界代表艾思奇、青年界代表刘光相继发言。最后大会全体一致通过，以大会名义电请国民政府明令国葬蔡元培，并电慰家属。唁电表示，蔡元培任北大校长期间做到了“网罗人才，兼收并蓄，学术思想，主张自由”，所以，“伟大的五四运动，实先生提倡诱掖，导其先路”。[111]
4月15日，延安出版的《中国文化》杂志刊出了吴玉章的悼念文章，再次总结了蔡元培革命一生中“可纪念”之处：一是“中国初期知识分子学生革命运动的重要发起人”；二是组织华法教育会，倡导勤工俭学；三是出任北大校长，领导五四新文化运动；四是组织民权保障同盟，为保障人权而奋斗。[112]吴玉章的叙述和评论中规中矩，论断总体上亦未超出上述《新中华报》短评及《新华日报》社论，也可以说，对蔡元培生平事迹的选取和评价已经基本定型。
1943年3月初，在蔡元培逝世三周年之际，《新华日报》又以《怀念蔡孑民先生》为题刊发社论，对蔡元培出长北大的历史予以评价，认为北大是中国革命史、中国新文化运动史上“无法抹去的一个名词”，而“北大之使人怀念，是和蔡孑民先生的使人怀念分不开的”。[113]社论表示：
蔡先生的主办北大，其作风，其成就，确是叫人不容易忘怀的，确是对于中国的革命事业有很大的贡献的。他的所以使人景仰不衰，同时也就是他的所以办学有成就，一由于他的民主作风，二由于他对青年的热诚爱护。……被蔡先生这种民主作风和爱护青年的精神所笼罩着的北大，不仅成为中国新文化的发祥地，同时也成了中国革命优秀干部的培养所。这就是北大永远不能使人忘怀的原因。我们怀念北大，我们更怀念到蔡先生。
中共对蔡元培的评价，特别是对其在担任北大校长期间所做贡献的定位，是通过肯定北大在近代革命史和思想史上的特殊作用而实现的。可以说，中国共产党对蔡元培的各种纪念，绝大部分被纳入现实政治之中，皆不难从政策层面找到理论上的支持，由此也带有更多政策宣传的色彩。
1945年1月11日，胡绳也在《新华日报》上发表文章盛赞蔡元培是“争民主的战士”。文章将具有蔡元培标志性色彩的“无所不包”以“民主作风”加以解释：
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