与此同时，对苏联时期的生态破坏，没有采取任何重要的整治措施。咸海日益干涸，化学工业和棉花生长对它造成了损害。虽然5个中亚国家的领导人在1994年1月和1995年2月两次开会研究咸海的未来，但无论是乌兹别克斯坦还是土库曼斯坦——它们两国抽走了需要留在咸海中的大部分水——都不愿意减少水的消耗量。棉花单一经营——民族主义者对此曾长期加以反对——仍然是经济的支柱。
上库曼斯坦保持着同乌兹别克斯坦一样僵硬的专制独裁制度——甚至在莫斯科已宣布改革时，当地的共产党领导人仍阻止任何反对派的发展——并且在那里搞斯大林和毛泽东式的个人崇拜。萨帕尔穆拉德·尼亚佐夫总统的画像随处可见，鼓励人们佩带有他的肖像的毛式徽章。任何萌芽状态的反对活动都被警察行动迅速镇压下去。1994年，尼亚佐夫搞了一个“全民投票”，据报道，99.9％的人投票赞成不需要举行原定于1997年的改选，而是让他的总统任期延长到2002年。
土库曼斯坦的经济状况比其多数邻国要好，但这并不是因为它有更出色的管理。巨大的天然气蕴藏使土库曼斯坦具有现成的出口产品，尼亚佐夫用出售天然气的所得来支撑经济。1994年，他宣布了在小企业实行私有化的方案，但它进展缓慢，看来不可能允许发展真正的私营经济，因为那将减弱尼亚佐夫对国家的控制。
出于同样的原因，尼亚佐夫对许多俄罗斯人想在土库曼斯坦得到特殊优惠的企图加以抵制。反之，他建立了与伊朗及西方的联系。例如，土库曼斯坦是第一个成为北约和平伙伴的中亚国家。然而，这种联系不太可能转变为普通民众更大的自由和更好的生活状况。尽管除了俄罗斯之外，土库曼斯坦比其他前苏联共和国赚取外汇更容易，但尼亚佐夫政权不能有效地利用它来促进国家的发展。但是，它足以避免可导致起义的生活必需品极度匮乏的状况。
塔吉克斯坦是苏联最穷的共和国，也是运气最坏的共和国。苏联解体后不久，它就陷入内战，数万人伤亡，数十万人成为难民，屠杀取代了经济发展。
内战开始于1992年，交战双方一方是一直统治着国家的共产党官员，一方是穆斯林、民族主义者和民主派的联盟。共产党的军队最终赢得了战争，它得到了应政府要求而来的俄罗斯军队的某些帮助，但是反对派继续在国外进行政治上的反对活动，并从阿富汗——很多支持伊斯兰复兴党的人在那里避难——进行武装袭击。
现在，俄罗斯的边防军继续保卫着它同阿富汗的边界。战斗是零星的和小规模的，但它继续存在。1994年，联合国倡议塔吉克政府代表与在国外的反对派政治家举行会谈。尽管达成了临时停火协议，但是反对党被政府宣布为非法，不能在1994年11月的总统选举中提出自己的候选人，因而它拒绝承认埃莫玛利·拉赫莫诺夫当选为总统的合法性。因此，当塔吉克斯坦进入1995年时，它的停火协议很不稳定，随时可能被打破。
与此同时，塔吉克斯坦要完全依靠俄罗斯，才能继续作为一个有组织的国家而存在。俄罗斯军队保卫着它与阿富汗的边界，俄罗斯还是它经济援助的唯一来源，尽管数量很少。在非俄罗斯的前苏联共和国中，只有塔吉克斯坦继续使用俄罗斯卢布，某些官员还谈到将俄罗斯与塔吉克的经济合为一体。然而，莫斯科对承担维持塔吉克生存的负担持怀疑态度，它鼓励尽力找到一种办法，以解决其内部的政治问题。
塔吉克斯坦的内战在其近邻中引起了很大反响，苏联政府以及某些中亚国家的政府常常以此为例，说明“伊斯兰原教旨主义”行为对于该地区的稳定造成的威胁。更靠近那里的人们对此半信半疑：塔吉克斯坦和中亚其他地方的穆斯林党派不同于伊朗那种引人注意的极端宗教原教旨主义。他们是逊尼派穆斯林，不同于什叶派穆斯林，虽然塔吉克人与伊朗人语言相近，但是他们对伊朗的毛拉统治持怀疑态度。因此，指责他们代表了“伊斯兰原教旨主义”在该地区的进攻，似乎主要是共产党官员的一种借口，以利于他们牢牢掌握权力，并把穆斯林的信徒排除在政治进程之外。有一点很能说明问题，即在塔吉克斯坦，穆斯林抵抗组织在反对共产党统治的斗争中与倾向西方的民主党派结成了同盟。
就塔吉克斯坦而言，战争看来难以停止，国家也难以得到再生的机会，除非现在的统治者听从劝告，同这个国家的其他政治力量分享权力。俄罗斯军队或许能够阻止全面内战再次爆发，但它没有能力完全消除该国的战争。如果俄罗斯能以撤走军队、取消经济支持——除非现政权与其对手达成妥协——相威胁，那么，俄罗斯就能够最有效地维护它自己的利益，维护该地区的利益。
俄罗斯的少数民族
像其他前苏联共和国一样，俄罗斯在推翻了苏联的统治之后，在其少数民族的处理方面也面临着严重的问题。戈尔巴乔夫曾鼓励俄罗斯的“自治共和国”要求更大的自由，以削弱叶利钦的权威，利用这一契机，俄罗斯联邦的很多地区开始要求享有主权。在大多数情况下，地区领导人更关注自然资源的所有权、征税权以及在俄罗斯议会上院中的地区代表形式，但有些人也企图获得独立。
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