总顾问委员会成立的头几个月内，做了大量工作来恢复原子能计划。洛 斯阿拉莫斯的物理学家集中精力改进原子弹的设计，同时又新建了两个实验 室。与此同时，奥本海默继续为国际管制原子能的主张奔走。虽然实现这一 点的希望越来越渺茫。他当时担任政府与国防部门的顾问，用关切的心情关 注着美苏之间愈来愈激烈的宣传战。他公开声明他担心这种宣传可能导致过 分热心的政治家作出无法兑现的承诺。作为一个当时正在受严格审查的左翼 同情分子，他却对苏联所谓“冲突是不可避免的”的态度进行了尖锐的批评。
在奥本海默与以他为首的委员会领导期间，至少在物理学方面使美国进 入了一个启蒙时期。在这方面有充裕的经费，精湛的设备，也有一种大发展 的气氛。1948年是奥本海默战后生涯中的高峰。人们称他为“原子弹之父”，
《时代》杂志在封面上刊登了他的巨幅照片，名扬四海。各报刊还广泛引用 他的一段得体谈话，其中表达了他与其他参加曼哈顿计划的科学家的那种忏 悔心情。“无论是指责、讽刺或赞扬，都不能使物理学家们摆脱本能的内疚， 因为他们知道，他们的这种知识本来不应当拿出来使用。”
奥本海默受到科学界绝大部分人的衷心尊敬，但他对核武器的这种态度 已不合时宜。随美苏冷战的升级及美国右翼势力的抬头，对奥本海默的政治 迫害也迫在眉睫了。
十、反对发展热核武器
美国政府一直很自信地认为苏联一时研制不出原子弹，杜鲁门曾问奥本 海默：“苏联什么时候能研制出原子弹？”“我不知道。”奥本海默回答。
“我知道。”杜鲁门说。“什么时候？”“永远也研制不出来。”
但是杜鲁门的这种自信很快就崩溃了。1949年9月，美国空军一架属于 远距离探测系统的飞机，在西北太平洋上空飞行时追踪了一块形态可疑的
“云”，在收集到的空气样品中发现其中含有原子弹爆炸时特有的放射性元 素。接下来的追踪分析则证明：苏联在前不久爆炸了一颗原子弹！
奥本海默深恐美国当局引起惊惶失措的反应，以及未经深思熟虑就草率 制订新的政策。因此他建议杜鲁门赶在苏联之前把此消息通知美国人民，结 果却引起“政府及人民的一片近乎歇斯底里的反应”。
正在洛斯阿拉莫斯从事“超级弹”（热核武器）研究的爱德华·特勒正 在为得不到奥本海默等的经费支持而充满怨恨。现在他认为他的机会来了。
早在1942年，特勒在奥本海默领导下从事裂变时，就提出了研制超级弹 的可能性，即利用裂变反应产生足够的热量以引起两个氢原子的聚变，从而 产生更巨大的能量，导致空前的爆炸。当时人们都认识到研制超级弹首先取 决于裂变弹的成功，但没有人认识到进一步制成超级弹究竟有何困难。当时 是战争期间，受各种条件限制，制造超级弹的计划只好搁置。为此特勒与奥 本海默发生了直接冲突。
特勒不顾奥本海默的劝告，与劳伦斯和阿尔瓦雷斯商议制订一项研制超 级弹的紧急计划。
奥本海默不赞同他们的建议。当时，原于能委员会下属的各实验室已研 制成功爆炸力的500000吨梯恩梯的常规裂变武器——比毁灭广岛的原子弹 威力大25倍之多。这种炸弹已足以毁灭地球上的任何目标，还有什么必要再 去研制超级弹呢？他在给科南特的信中还道出了他“真正的忧虑：真正使我 担心的还不是技术问题。虽然我还不能肯定这种炸弹是否能够成功。或者能 否不用巨大的拖车就将它运向目标，我认为更重要的是它可能进一步加剧我 国目前军事计划的不平衡。我担心这件事过份吸引了国会议员与军事人员好 像只有超级弹才是回答苏联挑战的唯一途径。当然，反对研制这种武器是不 明智的。虽然到目前为止还没有实验能够明氢弹能够成功，我们过去一直认 为必须发展它；而当前也认为必须发展它。然而，如果我们把拯救美国与世 界和平的全部希望寄托在这样一件武器上，那将是一条极为危险的道路。”
奥本海默在此只是说明超级弹不一定能够成功，从而提醒政府不要忽视 有同样作用的其它许多现实的军事措施。
10月29日，总顾问委员会召开会议，会上大家都认为美国目前不应当 率先进行一项全力发展核武器的计划。会后，总顾问委员会以全组名义起草 了一份送交原子能委员会的报告，希望“采取某种措施，能够使两种武器都 停止发展。……我们一致认为目前全力以赴地发展核武器将是错误的”。
在奥本海默与他的总顾问委员会的努力下，在 1949年最后两个月中，虽 然各种团体在幕后活动施加压力，美国政府的官方立场仍然是拒不发展超级 弹。
1950年1月27日，英国驻美大使馆紧急通知美国政府，英国已经逮捕 了原子间谍克劳斯·富克斯，后者已供认在整个战争期间以至战后一直向苏 联递送情报。富克斯曾在洛斯阿拉莫斯的专利委员会内负责登记工作，因此， 人们相信苏联必定已经知道有关裂变弹与超级弹的全部重要机密。杜鲁门立 即召见国务卿艾奇逊，国防部长约翰逊和利连撒尔。见面后，杜鲁门问道：
“俄国人能制成氢弹吗？”三人都点头说：“是的，他们能。”杜鲁门说：
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