在不断的实验中，贝采里乌斯更加深了对化学的兴趣。在当时的乌普萨 拉大学，化学并没有受到太大的重视，也很少有哪个大学生想要专门献身于 这门学科之中。但贝采里乌斯此时已深深地爱上了化学，并开始努力解决自 己在研究某些化学现象时出现的难题。1799年的暑假，他是在一家玻璃店里 度过的，在那里他向一个意大利人学习了焊接玻璃和制造玻璃器皿的技艺。 这项对于实验室工作极为重要的技能，在以后总是令他的学生们感到惊叹不 已。这一年的冬天，他给麦地维矿泉水产地的一位医生当助手，1800年冬， 贝采里乌斯对麦地维矿泉水进行了化学分析，并以此作为他学位论文的题 目。
这时候，在电学方面，意大利人伙打发明了能产生持续电流的伏打电池。 很快，善于接受新事物的贝采里乌斯也制造了一个伏打电池，并用来研究电 流的生理学的和医疗的效用。利用这一装置，他成功地使一位残疾人的一只 病手恢复了灵活性。对这些实验的体会成了他博士论文的基础。1802年5月， 贝采里乌斯在乌普萨拉大学进行了公开的博士学位论文答辩，因而完成了获 得医学博士学位所需的一切。同一年，瑞典皇家医学会任命了刚满23岁的贝 采里乌斯为斯德哥尔摩医学院医学和药学讲师。从此，他开始了自己的教学 生涯。
1807年，28岁的贝采里乌斯被任命为化学和药学教授。此时他所任教的 医学院医疗系只有三个教授，因此，每个教授要开好几门课。贝采里乌斯开 的是医学、植物学和药学的课程，不久以后他又开了化学课。在一开始，他 的药学课很受学生们的欢迎，但来听他的化学课的人却是寥寥无几。这是因 为，在当时的化学教授们讲课时只注重口头讲述而通常不进行任何演示和实 验。这种化学教学法在许多大学中是有传统性的。只用口头评说各种物质的 性质和组成，却不作化学反应的直观实验，不仅对于讲授来说是很困难的， 就是对于学生们来说，这样抽象的化学课也是十分枯燥难懂的。因此化学课 不受欢迎也就可想而知了。
贝采里乌斯力图改变这种局面。他在讲课中大大增加了实验次数，把直 观的化学实验引入了课堂教学之中。不久，他上化学课的教室就逐渐挤满了 前来听课的学生。他的这种化学教学法也很快被其它许多大学所采用。
在进行紧张的教学活动的同时，贝采里乌斯也积极地投入到科研活动 中。1802年，他进行了电化学的研究，1803年2月，他将研究成果总结成一 篇论文，这篇论文包括了贝采里乌斯以后提出的电化学理论的全部基本原 理。同一年，贝采里乌斯与本国化学家赫新格尔在进行化合物分解的研究过 程中，共同发现了化学新元素铈，同时也精确地测定了这种新物质的性质。 就这样，在此以前默默无闻的24岁的雅各布·贝采里乌斯在化学界出了名。
1806—1818年，贝采里乌斯与赫新格尔编辑出版了期刊《物理、化学和 矿物学丛刊》，这本刊物在物理学、化学界的影响日益加深，贝采里乌斯也 经常在这一刊物上发表自己的各种研究成果。
在1806年，贝采里乌斯自己动手编写了生理化学教科书。就在这一年， 他第一次把“有机化学”的概念引入了教学之中。1808年，他着手编写了《化 学教科书》一书，这是日后许多国家的几代化学家都学过的一部教科书，对 科学的发展做出了巨大的贡献。从1807年开始，在以后的6年中，他还进行 了测定各种盐、酸、氧化物与其他物质组成的基础的研究。
由于贝采里乌斯对科学界与教育界的贡献巨大，在1808年，他被选举为 瑞典科学院院士，1810年又被选举为瑞典科学院院长。工作繁重的贝采里乌 斯对于这种种的荣誉并没有看得太重，他依然脚踏实地地进行自己的科研与 教学工作。
作为一位科学工作者，贝采里乌斯非常注意了解世界各国最新的科学研 究进展，他积极与外国科学家们进行不断的联系，这进一步扩展了他科学观 点的广度与深度。还是在科学活动的初期，他就已经同许多著名的学者，比 如法国的贝尔托勒、英国的戴维等人建立了通信联系。1812年夏，贝采里乌 斯应英国皇家学会会长戴维的邀请，访问了英国皇家学会，通过戴维的介绍， 他还结识了学会的许多杰出的代表人物。在以后的5个月中，贝采里乌斯与 戴维进行了共同的化学研究，取得了许多共识，并且互相纠正了对方的一些 错误观点，进一步加深了他与戴维的学术联系。1818年春天，贝采里乌斯由 于过度疲劳而生病了，医生和朋友们都建议他能够暂时停止化学研究，到外 国进行旅行疗养。他听从了劝告，作了长时间的出国旅行，访问了英国、法 国、瑞士和德国。旅行期间，他又结识了欧洲的许多大学者。他在法国巴黎 呆了10个月，与法国学者们相互交流了研究课题，贝采里乌斯从中得到了许 多非常有益的启示。1820年10月，他回到了斯德哥尔摩，又开始了新的科 学研究。
此时的贝采里乌斯，已经成为世界著名的学者。他研究的范围极广，化 学上的大问题几乎没有一个没有参加研究过。
为了更好地总结当时科学的发展情况，从1821年开始，他着手出版《物 理、化学进展年报》。直到他逝世，年报一共出版了27期，这些年报是19 世纪上半期有关化学、物理学和矿物学方面最具权威性的文摘性刊物。
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