重复杂交与远缘杂交也是十分重要的。杂交可以产生变异，植物育种家 可以从大量的变异群体中挑选出称心如意的个体，但杂交育种往往不是一蹴 而就。也就是说，往往不是一次杂交就能见效的，经常要进行多次反复的杂 交。
两个亲本之间的杂交，可以把两者之间的优良特性综合在一起。杂种在 遗传上是比以前更丰富了。但在实践上，两个亲本的杂交有时仍然不理想。 为使后代的遗传内容更丰富些，常常采用多亲杂交。在布尔班克的试验中， 采用多亲杂交或复合杂交也是一大特色。
布尔班克在培育李的试验中，有一种“混合李”，它的谱系更为复杂， 几乎包含了每一种栽培李的家系。从这个奇异的种子长出来的树所表现的性 状来看，至少同20个全然不同的李的变种密切相关。在长达30年的实验研 究中，对多次亲本的杂交，布尔班克无法留下详细的记载，只能知道第一次 杂交所使用的原始亲本。因为在以后若干代中，需要处理的实生苗实在太多 了，有些杂交又是由蜜蜂来帮助进行的，布尔班克不可能去准确地记载多次 杂交的亲本，这样太耗费时间和精力，他的眼睛始终只是密切注意实际的成 果而不是繁琐的记录。但毫无疑问，这些杂种是很多亲本反复杂交后把遗传 因素融合到一起的。
在以上这些多个亲本的复合杂交中，可以看到它们虽是不同的种，但在 血统或亲缘关系上还不算太远，表现在它们的杂种后代都能正常的生长、开 花、结果。有些不同的种或变种，由于地理上的阻隔彼此无缘相见，也可以 说这些种或变种在地理上是远缘的。地理上的远缘的种或变种之间的杂交习 惯上叫做“远距杂交”。在布尔班克的育种实验中，有很多是远距杂交。杂 交亲本一般地说是同一种植物的不同“变种”，或者是性状分歧还未达到极 限的“种”。由于长期处在不同的生态地理条件下，通过年代久远的变化， 形成了各自的遗传性。将这些不同的遗传性综合在一起，杂种往往表现出非 凡的生长能力和结果能力。布尔班克培育的皇家胡桃就是一例。另外，在沙 斯塔雏菊的培育中所用的四种雏菊，也是远距杂交的范例。
在布尔班克的实验里，有很多是真正的远缘杂交，即超越物种界限的杂 交。这是十分大胆的方法，是布尔班克的前人及同时代其他人所不敢采取的 方法。
按照植物分类法，世界上所有的植物都归入不同的门、纲、目、科、属、 种和变种之内，按照一般的法则和实际杂交结果，在同种不同变种之间杂交 是没有什么麻烦的，而不同种之间的杂交则经常不能成功。但是，布尔班克 认为这个一般的法则绝不是一成不变的，这中间，时间是一个限制因素，只 要有足够的时间去进行实验，不同种甚至不同属的植物界限都是可以打破 的。
关于远缘杂交，布尔班克在他的试验中看到了三种情况：一是不同种或 不同属植物杂交后，它们能够结合在一起并产生能育的后代，这些后代将构 成一个新的种或新的属；一种是不同种、属的植物杂交可以结合得到后代但 后代表现不育，正像动物中马和驴杂交的情形一样，植物中也会产生不育的
“骡子”；第三种情况是某些不同的植物种、属完全不能互相结合，也就是 说完全不能杂交，就像水和油不能结合在一起那样。
布尔班克用李和杏杂交，这是两个不同的种，但是杂交的结果都产生了 能育的后代。布尔班克通过选择和培育得到了李—杏杂种，这是一个崭新的 物种。
他还用大花烟草和矮牵牛杂交。这是两个不同的属。结果得到了一种新 型植物，布尔班克称它为“带烟瘾的矮牵牛”，这个杂种显示了混合的性状， 但是根系发育不良，没能继续繁殖后代。
他用一种野生马铃薯和茄科中的其他块茎植物进行杂交，这种远缘杂交 产生了一种杂种马铃薯，它很少结薯块，而在植株上长了很多大而甜的种子 球，果实坚实，颜色雪白，香气浓，吃起来酸甜可口，品质优于番茄，因此 名叫“马铃薯番茄”，但它与番茄完全没有关系。
其他品种的杂交还包括：用匍匐黑莓与苹果、梨、山楂、蔷薇，用草莓 和树莓，用葛拉文斯堡苹果和巴梨，用文殊兰和真正孤挺花……布尔班克的 试验范围相当广泛。通过多年的实践，他得到了很多有益的知识，他要人们 记住，理论多数是环绕死亡的植物而创立的，而我们要用的事实应该在活的 植物中搜集，“让我们坚持活的植物告诉我们的事情。”
选择，在植物育种中至关重要，大自然在植物长期进化过程中也创造了 无数的变异类型，仅凭选择，人们也可以改良植物。例如，人们长期以来把 野生植物引入栽培，通过选择，使现有的栽培植物种无论在产量上和品质上 都大大超过野生种。栽培苹果比野生苹果果实大，品质好；栽培的马铃薯比 野生的薯块大，产量高。从野生植物到栽培植物，就是一个引种和选择的过 程。杂交工作也离不开选择，首先就是要选定育种目标，为此必须选择某些 理想品质的亲本；然后再让这些亲本杂交。在杂交后代中，不停地选择、再 选择，这样直到选出满意的类型为止。所以，植物改良中任何理想的实现， 第一个因素是选择，最后一个因素还是选择，选择贯穿于育种工作的始终。
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