1628年7月，开普勒向他工作了多年的奥地利议会提出辞去地方数学家 的职务，并得到了批准。在和睦的气氛中，开普勒离开了奥地利首府林茨， 这是开普勒居住时间最长、科学成就最丰硕的地方。
1627年12月，开普勒来到布各，向费迪南德二世皇帝呈交《鲁道尔夫 星行表》的样本。在这座“因胜利而名震天下的皇帝的金碧辉煌的宫殿里”， 开普勒惊讶地遇到了一大批他的著作的支持者和赞赏者。哈布斯堡王室的世 袭领地已经成了他的第二故乡，只要他愿意，他可以在这些领地里，包括布 拉格在内，继续为皇帝工作。皇帝的顾问们向开普勒提出了各种各样的建议， 但所有建议都必须以皇帝规定的条件为前提，开普勒成为天主教徒。
耶酥教团被委以使开普勒“皈依”的任务。因为开普勒的宗教立场是和 平、统一、和谐，所以，他早在年轻时期就与耶酥教团成员有着亲密友好的 关系。而且，开普勒是被自己的教派开除了的路德派分子。所以，耶酥教团 认为开普勒除了不好意思以外，还有什么东西能阻止他采取对他一生来说都 将是十分有利的这一步骤呢？但开普勒给耶酥教团的答复表明，这个把真理 看得高于一切的人决不将宗教信仰作交易。“如果我现在才开始成为天主教 徒，那就将是我对上帝的不敬。我一生下来就被父母带到天主教堂受洗，并 接受了上帝关于父子之道的精神训诫，从那以后我从未离开过教会。”开普 勒看来，“天主教的”并不是指一种教派立场，而是“唯一的教会，任何时 候都是同一的教会，它的分支都是死的。”他认为“新教”并不是“天主教” 的对立面。开普勒一生都拥护温和的梅兰喜顿为基督教的统一而起草编写的 奥格斯堡信条。在他看来，它才是真正的宗教改革的体现，才是教会复兴的 体现，才是对世俗的滥用的纯洁，而激进的路德派的新教信条在他看来，并 不是真正的宗教改革。
开普勒称“我是一个基督徒，是教会的儿子，我尊重天主教的学说，不 仅是用心，而且是用脑子，而到了我现在这个年纪，我已经能掌握它了。因 此，开普勒完全拒绝任何背弃真正的基督教信仰和基督博爱精神的作法。他 表示：“我留在天主教里，但我拒绝非信徒的，即非天主的东西。为此，我 准备不仅放弃尊贵的皇帝陛下仁慈慷慨地同意了的，现在供给我的酬劳，而 且也准备离开奥地利，离开整个帝国，以及放弃最高贵的天文学，并且还可 以加上我的生命，不是上天赐予的东西，人就不能接受。”
开普勒的向费迪南德二世的宫廷表达的这种明显拒绝的态度，使所有的 大门都关闭了。正在这个时候，掌握哈布斯堡王室命运的哈布斯堡王室军队 的最高统帅、藐视一切宗教只迷信星辰酷爱占星术的瓦伦斯坦成了开普勒的 最后一位大资助人。
1628年4月，这位最高统帅向他在萨冈的行政长官下达了命令：为“尊 敬而博学的约翰内斯·开普勒准备一套价格相宜的舒适住所，并提供一切方 便。”从此，开普勒经过无数辛酸的失望之后，冒险留在瓦伦斯坦统帅身边， 继续自己的研究工作。他为自己规定的第一个任务是计算星历表。第二个任 务是作为帝谷·布拉赫的继承人，要尽快出版帝谷的观察资料。第三个任务 是着手撰写以食蚀理论为基础的天文学著作。
1629年底，开普勒的星历表完成了，他将其中的一卷献给了瓦伦斯坦。 然而，正当他着手印制他的最后一本著作《月亮之梦》的时候，皇帝费迪南 德二世和他的最高统帅瓦伦斯坦之间出现了严重分歧。1630年6月，皇帝在 雷根斯堡召集了选帝侯会议。在这次会议上，天主教同盟的诸侯们成功地促 使皇帝撤掉了瓦伦斯坦。
瓦伦斯坦和费迪南德二世的紧张关系使开普勒寝食不安。因为他们俩人 的关系会直接影响到开普勒的未来。开普勒决定前去雷根斯堡，当面向皇帝 陈述他的不安，并去看望瓦伦斯坦。他还想去一趟林茨，因为他手中还握有 林茨议会欠他的债券。
开普勒带着他的星历表的样本和所有能证明他财产的文件于1630年11 月到达了雷根斯堡。到达后第三天，他就连续高烧，一病不起。于1630年 11月15日溘然长逝。
开普勒的一生，充满了艰难和困苦，在他59年的生活中，他遇到了太多 的不幸和心酸：宗教的迫害、亲人的死亡和战争的灾难接踵而来。开普勒就 是在这样艰难的环境中，不仅发展了天文学，改革了天文学，而且成为理性 的新世界和宇宙和谐的宣告者。
中外科学家发明家丛书：柯瓦列夫斯卡娅
一、不幸的童年
索菲·柯瓦列夫斯卡姬于公元1850年1月生于莫斯科。她的祖父瓦西 里·谢缅诺维奇·克柳科夫斯科伊，是一名移居俄国的波兰地主，他在天文 学和数学方面颇有成就。她的父亲名字叫瓦西里·瓦西列维奇（1801—1875 年），是一位俄国陆军中将。1819年他进入彼得堡炮兵学院学习，后来在军 队中服役直到1858年。他是一位很有学问的人，对英语、法语及自然科学很 精通。他的妻子叶利查维塔·费多罗夫娜（1820—1879年）是一位性格活泼、 才华横溢的女性，并对音乐有较强的感受力。1843年1月他们俩结婚。由于 柯瓦列夫斯卡娅的母亲小于丈夫19岁，因此她常感到很压抑。结婚以后，他 们住在莫斯科，开始了她并不愉快的婚姻生活。柯瓦列夫斯卡姬的父亲既独 断又固执，不允许妻子参加各类社交活动，使她几乎与世隔绝。而他自己则 挥霍无度，靠纸牌、赌博等消磨时光。因此，这个家庭自始就笼罩着不愉快 的气氛。
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