考订本草，这是李时珍深思熟虑之后确定的主攻方向。由于李家的家庭 环境和个人的切身经历，他深感“本草一书，关系颇重”（李建元《进本草 纲目疏》），它不仅影响医生的技术发挥，更重要的是关系到病人的健康和 生命安全。而且本草的各种错误代代相传，危害大，李时珍出于对国家和民 族的高度责任感，更坚定了他考订本草的信心。
这一年大约是明朝嘉靖二十三年以后，李时珍三十岁左右的时候。
李时珍把自己的想法告诉父亲，父亲惊奇地说：“你是想重修‘本草’ 吗？这可不是件简单的事啊！”
重修“本草”的艰难程度，李时珍当然是知道的。编修一部新的“本草”， 必须要改正旧的，补充新的，而且要保证编修的正确性，不知要花多少人力、 财力。
李时珍又问父亲：“唐慎微他们是怎样编修‘本草’的呢？”
李言闻说：“那是经朝廷批准的，不然的话，谁有力量去做呢？”
李时珍说：“我们也可以请求朝廷批准啊！”
李言闻苦笑着反问：“朝廷能批准我们这样的人来修订‘本草’吗？”
明知山有虎，偏往虎山行。李时珍发现修订“本草”这件事，实在是困 难重重，可是，他太了解修订“本草”这件事的实际价值了，无论如何，他 也不能任凭错误百出的“本草”再世代相传，误伤百姓了。
于是，他开始了漫长而艰难的编修“本草”的准备工作。
他一边行医，一边大量阅读与“本草”有关的各种书籍，以丰富自己在 医学方面的学识。
为了提高自己的阅读、写作能力，他还读了大量的经史百家名著，做札 记，谈认识。他还读了许多前人未加注意、未曾引用的书，企图从古代学术 宝藏中挖出更多有价值的东西。如王维的《敕赐百官樱桃》诗，告诉他蔗浆 是寒的，使他更了解蔗浆泻除中热的功用。他还从苏辙的“客来为说晨兴晚， 三咽徐收百玉浆”两句诗中，得知了栗子的妙用。他用之于临床治疗，也发 生了效力。
有一次，他读过《楚辞》中的“将与鸡鹜（wǖ）争食乎”，“将泛泛若 水中凫（fú）乎”两句。立即发现了陶弘景、寇宗爽等人把凫与鹜混淆的说法， 严格地辨明了二者的区别。认为古“凫”看做野鸭，而“鹜”则是一个家鸭。
李时珍也不轻视稗官小说，这使他收益很大。他利用行医的空闲时间， 把握一切可读书的时机，阅读了好几百种象《泊宅编》、《两山墨谈》那样 的笔记。刘贡父的《芍药谱》、沈立的《海棠谱》、范成大的《菊谱》、戴 凯之的《竹谱》、叶廷珪（guī）的《香谱》、苏易简的《纸谱》等等，他也 都细细地阅读、研究。在后来他为编撰 《本草纲目》而对各种药物进行考证 时，这些谱录式的作品给了他很大的帮助。
对于边远地方的药物生产情况，他不大容易了解。因此，李时珍对于象
《南方草木状》、《桂海虞衡志》、《凉州异物志》这类书下过一番功夫。
明朝永乐、宣德年间，郑和等人七次下西洋。跟随他们去的一些人，如 马欢、费传、巩珍等人，回来后都写了书，叙述沿途经历和各地风俗材料， 李时珍便利用他们所供给的材料研究外国药。
在读书的过程中，李时珍总是细心地分析、研究、思考。他一方面肯定 书中正确的方面，同时，对书中的矛盾的地方、有疑问的地方，都—一摘录 下来，以便核实和更改。
在阅读各类书籍的过程中，李时珍发现“本草”书远远不能囊（náng） 括医家的丰富经验。从《证类本草》问世到李时珍生活的明代，已经过去四 个多世纪了。这四百多年来本草学仍然在继续向前发展。
随着医家与各种疾病的顽强斗争中，一些医生积累了大量的、有价值的 经验，在古代医学的基础之上，又有了新的收获。
金、元时期有四大医家闻名于世，他们是：主张用寒凉药的刘完素，他 针对宋代的古板的医务制度——规定医生处方用药必须使用官方颁布的方 剂，使用成药也不许任意变化配方——主张处方用药要注重实际，因人而施。 病人的生活状况、所处环境及病情各不相同，用药也应该有差异，不能强求 一律。常用攻下药的张子和，敢于用峻激的泻剂和吐剂，广泛应用“攻病三 法” （即发汗、催吐、泻下），注重攻法，慎用补法。擅长用补养脾胃药的 李东垣，研究滋阴降火药的朱丹溪。刘完素、张子和、李东垣 （yúan）、朱 丹溪四家，即所谓：“金元四大家”，提出了不应当盲目搬用古方的观点， 指出了旧医书和本草的许多讹误不足之处。他们研究新药理，推广新药效， 发现新药物，讨论如何组成新的有效方剂，出现了良好的争鸣气氛。他们的 学术争鸣对李时珍的思想产生了深刻的影响，更增强了他重新修订本草的意 愿。
另外，宋元时期海陆交通日益发达，对外贸易超过了唐朝。1973年，考 古人员在福建省泉州湾发现了一艘宋元时期沉没的海船，船舱中除有大量的 古铜钱和瓷器外，还发现许多药物，如沉香，檀香、水银、朱砂、胡椒等。 由此可见，那时我国与国外医药学交流已经相当发达。那么，宋元时期引进 的一些药品就没有归入“本草”书中，需要在书上填补新内容。
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