李自成和张献忠带着兵闯入的就是这样的凤阳。他们从陕西逃窜到河南，居然没遇到什么阻碍，那些当地官员都是以赶为主，而根本不剿灭，他们这一路向东非但没有损失兵卒，反而又聚集了大量的饥民，如今主力也有四万人，到了凤阳早就在凤阳城外的山间埋伏了下来，正好今天天降大雾，张献忠一合计，便决定今日进攻。
进攻比他们想象中的要简单，打头的队伍大摇大摆就进了凤阳城，张献忠计上心来，命令先遣部队在凤阳城内四处放火，趁着大雾，将城中的大都督府、御史台、圜丘、方丘、日、月、社稷、山川坛等一把全烧起来，又派人在城内大喊：“叛军打进来了！”，同时城外的大部队金戈铁马踏步进攻，犹在雾中沉睡的明军仓皇起身，由着镇守凤阳的明将朱国相领兵迎战。
但由于两支队伍战斗力悬殊太大，起义军本是农民，但由于这半年里四处跟人打仗，已经渐渐在不停的战斗中经受了洗礼，迅速成长起来，很快明军便战败，输得一塌涂地。
四千多名大明士兵被俘获。
守将朱国相情知自己守城不利，看着大势已去，拨刀自杀。
张献忠命人在凤阳燃起了大火，中都的日、月、社稷、山川坛尽数在火光中化为灰烬。他又命人烧毁皇陵、龙兴寺。
火势蔓延到整个中都，禁垣东侧用来禁锢宗室子弟中罪臣的凤阳高墙也被殃及，高墙军守卫或死或逃，谁还记得宫阙五墙内的罪臣？不久火势蔓延起来，只听得一声声惨叫传出。
中都的崇垣深渠、门楼敌台都陷入了熊熊大火，曾经的享殿丹陛、琉璃彩绘转眼化作青烟，
黑烟在城中冲起，直冲云霄，棂星门、御桥、皇城金门、砖城南明楼、太庙、钦天监、观星台、历代帝王庙，皆毁。鼓楼、钟楼只余残垣断壁。皇陵被盗挖，陵道内石像或被砸碎，或被掀翻，一片狼藉。
张献忠树立起旗帜自称“古元真龙皇帝”，他纵容着手下去凤阳城内烧杀劫掠，自己面对着冲天火光抚掌大笑：“朱元璋能成事，我便也能成事！”
皇陵内最著名的那道石碑也被烟熏得焦黑，那是洪武十一年由开国皇帝撰写的，
“……亲征荆楚，将平湖湘，三苗尽服，广海入疆。命大将军，东平乎吴越，齐鲁耀乎旌幢，西有乎伊洛崤函，地险河湟，入胡都而市不易，肆虎臣露锋刃而灿若星鋩。……
……勒石铭於皇堂，世世承运而务德，必彷佛於殷商。……”
“世世承运”四个字定定刻在石板上，仿佛一双眼睛，圆睁着看这大明。
消息很快传到了京师。
大臣们说什么的都有，这本来也在朱烟寒的意料之内，没想到一群宗室居然冲到太庙去哭先祖了。
太庙是第二代皇帝建立起来祭祀祖先的地方，中都凤阳有一座，南京有一座，开国皇帝的儿子迁都北京后在北京又建了一座。太庙占地极广，三层高墙耸立，黄琉璃瓦庑殿顶，内中古柏森森，殿中东殿供着历代有功朱姓王族的牌位，西殿则放着异心有功之臣的神位。平日里朱姓宗室祭祀都在自己家，倒没想到今日里宗室倒去太庙哭了。
朱烟寒能说什么？太庙供着的祖先也是宗室的祖先，谁能将奈何，便是皇帝也拦不住人家哭自己的祖先。摆驾罢，去看看同姓兄弟们。
太庙的庭院皆以白色大理石建造，宗室们跪成一片，看见皇上来了，却也恭敬的行礼，朱烟寒忙挥手免礼，里面有些人按辈分是自己的叔叔、伯伯，甚至还有爷爷辈的，怎么好叫他们行礼，再者，朱烟寒也想看看诸位葫芦里卖的什么药。
果然立刻就有人从队伍里站出来：“皇上，臣等恳请速速出兵镇压起义军，以告慰祖先在天之灵。不然祖宗在地下不得安宁。”
朱烟寒沉吟不语。
宗室们也不是吃素的，几个人一交换眼神，“哗啦”一声，太庙的汉白玉须弥座式台基底下跪倒了一片宗室，或是磕头，或是痛哭流涕。
朱烟寒叹口气，他指着太庙问：“今日在太庙前行家礼，诸位便都是朕的叔伯兄弟，朕且问诸位叔伯兄弟，你们看到了什么？”
宗室们顺着他的手指看过去，屋梁、屋顶，毫无看头，于是茫然的摇摇头。
朱烟寒看着重檐庑殿，沉重说道：“这太庙，内部大梁是千年一遇的沉香木，至今犹自散发着幽幽香气，那大殿立面，皆是名贵的金丝楠木，每一柱楠木都是耗费了巨大民力从南边运过来。”，他指着大殿外立面，“那大殿外部贴着的图案，全是赤金融成。”他目光移至院落中姿态古朴的古柏“那古柏，自太皇帝的儿子那一辈种起，如今也一百多年了。”
宗室们摸不着头脑，面面相觑。
朱烟寒接着说：“祖先们建立下这一片基业实为不易，诸位叔伯兄弟既然在这里痛哭，可见恨透了火烧凤阳的那群匪徒，我且问诸位，有没有想报仇的心？”
宗室们齐声点头：“想！”
朱烟寒叹曰：“朕岂是不愿意出兵？朕是没钱出兵。朕昨夜里清点宗实录，发现我大明宗室人口已有二十万！”
“二十万啊！一人吐口唾沫，可淹死叛军，一人扬一揪土，可活埋贼人。即使这些人不上阵，每岁也要禄米一千万石！万历年间，东倭之役花用七百万石禄米，播州之役费三百余万石禄米！若以这些禄米供养一支队伍，便可将如乌合之众一般的叛军打得落花流水！”