到了江户时代，日本儒学者为了使儒学摆脱对佛教的依附，才致力于儒佛之辨，对佛教的出世主义进行批判。但是，日本儒学的不同流派(朱子学派、阳明学派、古学派、考证学派、折衷学派等)却长期并存，只是江户时代后期的“宽政异学之禁”曾独尊朱子学、欲压制其他学派。尤应注意的是，日本的儒学者，除了极少数的例外(如室鸠巢、佐藤直方、三宅尚斋、赖山阳、太宰春台等)，大都对日本神道采取共存和融和姿态，主张神儒一致和神儒合一。江户时代以前的神道诸流派(如两部神道、山王神道、伊势神道、唯一神道等)固然也吸收了儒学与佛教的理论，但是，它毕竟保留了源自日本神话的固有思想。从这一意义上说，主张神儒一致或神儒合一，也可理解为主张儒学与日本固有思想的共存与融合。
江户时代的儒学者将儒学与固有思想相融含有两种类型。林罗山的“理当心地神道”，认为“本朝神道是王道，王道是儒道，固无差等。”还认为“神道即理也。”[29]林罗山是以朱子学的“理”的思想为日本固有神道奠定新的理性主义的基础。这属于以中国儒学的理性主义改造与取代日本神道的神秘主义的类型。山崎黯斋的“垂加神道”则以《神道五部书》中的“神垂以祈祷为先，冥加以正直为本”这一命题为基础，牵强地以阴阳五行来配合日本的天神七代，说:“天神第一代，天地一气之神;自二代至六中，是水、火、木、金、土之神；第七代，则阴阳之神也。”[30]在这里，山崎黯斋把作为理性产物的中国儒学阴阳五行说附会为日本神话中的神了。这属于放弃儒学的理性主义，强调与保存日本神道的神秘主义的类型。然而，无论哪种类型的神儒合一说，都反映了日本儒学者在吸收外来思想时，十分注意保存固有思想并将它们互相融合。
日本儒学与其他思想的多元共存，以及与固有思想的融合，从思想这一侧面表明了日本文化多元共存的性格，反映了日本人在接受外来文化时十分注意保存固有文化并将它们互相融合的传统。
日本儒学的特色，既是日本文化特异性格的产物，又是日本文化特异性格的表现。通过上述对于日本儒学的特色的考察，我们便可窥知日本文化重直观、轻抽象，重感情、轻理智，有用性决定文化选择取向，多元共存等特质(当然不是日本文化的全部特质)。
注释：
[1]依照《日本书纪》的纪年，应神天皇16年相当于公元285年。但一般认为，《日本书纪》的纪年，在雄略天皇前的部分都不可靠。据应神天皇的一些记事与较为可靠的朝鲜《三国史记》的有关记事相对照，依《三国史记》纪年，应神天皇16年应为405年。
[2](日)永田广志:《日本哲学思想史》，中译本，商务印书馆1978年版，第61页。
[3]详见拙文《试论儒家思想对日本〈古事记〉的影响》，《南开学报》1986年第2期。
[4]（日)和岛芳男：《中世的儒学》，吉川弘文馆1965年版，第250~251页。
[5]（日)《日本思想大系 28 藤原惺窝·林罗山》，岩波书店1980年版，第461页。
[6]（日)《日本思想大系 31 山崎黯斋学派》，岩波书店1980年版，第563页。
[7]（日)《日本思想大系 34 贝原益轩·室鸠巢》岩波书店1977年版，第503页。
[8]（日)《日本思想大系 32 山鹿素行》、岩波书店1976年版，第343页。
[9](日）《日本思想大系 33 伊藤仁斋·伊藤东涯》，岩波书店1980年版，第122页。
[10]（日)《日本思想大系 36 荻生徂徕》，岩波书店1980年版，第201页。
[11]（日)宇野精一等编：《东洋思想讲座 10 东洋思想在日本的展开》，东京大学出版会，1967年版，第288页。
[12]（日)中村元：《东洋人的思维方法》第一部·第二章， 书房1948年版。
[13]（日)源了圆：《文化和人的形成》，第一法规1983年版，第75页。
[14]（日)G·B·桑索姆：《日本文化史》，东京创元社1976年版，第5页。
[15]（日)源了圆：《德川合理思想的系谱》，中央公论社1977年版，第36页。
[16]同2，第112页。
[17]（日)奈良本辰也:《近世日本思想史研究》，河出书房新社1965年版，第108~109页。
[18]（日)相良亨：《近世儒教思想》，镐书房1982年版，第9页。
[19]（日)本尼迪克特:《菊花与刀》中译本，浙江人民出版社1987年版，第180页。
[20]（日)源了圆：《义理和人情》，中央公论社1978年版，第3页。
[21]（日)本尼迪克特：《菊花与刀》中译本，浙江人民出版社1987年版，第100~101页。
[22]详见拙文《试论儒家思想对日本〈古事记〉的影响》，《南开学报》1986年第2期。
[23]（日)《日本思想大系 8 古代政治社会思想》，岩波书店1979年版，第286页。
[24]（日)石田一良编:《体系日本史丛书 23 思想史2》，山川出版社1980年版，第92页。
[25]朱谦之，《日本的朱子学》，三联书店1958年版，第264页。
[26][27]同11，第309页。
[27]同11，第307页。
[28]同2，第70页。
[29]同2，第101页。
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