1802年4月，立法院通过政教协议和教会组织条例。4月11日，庄严的《赞美上帝颂》在巴黎圣母院演唱，这华丽壮观的仪式吸引着无数听众，拿破仑与许多将军也驱车前往。第二天，拿破仑问起奥热罗对仪式作何感想，这位将军答道：“全都非常好，什么都不缺，只少了为推翻你现在正建立的东西而死去的千百万人。"拿破仑颇为不悦。
拿破仑要利用亚眠和约所带来的短暂和平来巩固法国对殖民地的统治。早在督政府时代，圣多明各岛宣布脱离法国独立，著名的黑人领袖杜桑。卢维杜尔在这个岛上建立了巩固的领导地位。权力日升的拿破仑决定派兵远征此岛，使其重新归顺。1801年12月，一支远征军浩浩荡荡地离开了法国海岸。司令一职由拿破仑的一个妹夫勒克莱尔将军担任。之所以任他为司令，是因拿破仑对他嫌恶甚深。拿破仑对勒克莱尔将军说：“这是给你的训令。现在是你的机会，发财去吧，别再纠缠不休地向我要钱，惹我厌烦。"拿破仑给杜桑。卢维杜尔写了一封言辞动听的信函，提出只要杜桑能为圣多明各岛归还母国而卖力，就任命他为副总督。杜桑被这动听的言辞骗到了法军军营，立即遭到逮捕，并被押送到法国。
拿破仑下令把他监禁在一座荒山上的一间单独密室里。严寒的气候、残酷的监禁、不能同亲属会面、不能散步，最厉害的虐待终于使杜桑。卢维杜尔在监禁10个月以后就命归黄泉了。
短暂的和平给法国带来了繁荣和安宁。1802年的巴黎到处是一频繁华似锦、歌舞升平的新气象。每到检阅日，巴黎人全都涌往游艺场，兴致盎然地参加各种活动。自从三级会议集会以来，各种娱乐场所还从未接纳过如此众多的游客，各节庆日也从未显得如此壮观，首都也从未呈现出如此快乐的光景。人人脸上都挂着幸福的微笑，繁荣安宁的气氛到处可见，作为其缔造者的波拿巴无时无刻不感到荣耀和自豪。尤其是夏普塔尔先生在罗浮宫举办的工业产品展览会，让拿破仑大为满意，他为法国工业达到如此高的水平以及展览会引来众多外国人的赞叹而得意非凡。
国泰民安也为拿破仑集中权力、排除异己提供了机会。在这个时期，谁反对他或不尊重他，都会失去宠信。富歇是拿破仑在雾月18日政变中的得力助手。然而，富歇却是一个善于玩弄权术的阴谋家，拿破仑很清楚这一点，他说富歇玩弄阴谋如同他一定要吃饭一样。当时拿破仑的朋友全都反对富歇在政府中占有席位，可拿破仑舍不得一脚踢开他，因为执政府成立初期国内叛乱迭起，而富歇却在警务方面有着突出的才能。富歇被任命为警务部长。如今，富歇的权势愈来愈大，不仅在巴黎，而且在整个法国，富歇以其高超的能力笼络了一批支持者。拿破仑对这个反复无常、两面三刀的警务部长早有戒心，他决定趁现在国内太平解除富歇的职务。1802年9月12日，拿破仑表示他对法国目前的安全和国内平静具有信心，决定裁撤警务部。富歇的警务部长一职也就此结束。为了不激怒富歇，拿破仑任命富歇为参议员，并在向参议院推荐富歇的咨文中宣称：“富歇在困难时期担任警务部长，以其才能、活动和对政府的依附做到了情势要求的一切。虽然把他安插在参议院内，但如果事态再次需要警务部，政府将再难找到比他更可信赖的人选了。"就这样，拿破仑巧妙地除掉了这个心腹之患。
终身执政胜利与和迫使拿破仑成为一位受到普遍颂扬的英雄。为了表彰拿破仑的业绩，1801年5月4日，法国议会通过了执政任起再次延长10年的决议。然而，拿破仑对此并不满意，他的目标是要成为终身执政。他向参议院提出了这一要求，可遭到参议院的否决。他没有因此对参议院大加责难，而是对议案作了不动声色的回避性答复，他说：“如果人民的愿望要求参议院授与这10年任期，我将服从这新的牺牲。"他希望能从人民那里获得更大权力。
1802年5月10日，法国议会顺应了拿破仑的愿望，决定将下述问题提交人民决定：“是否任命第一执政为终身执政？他能否有权指派继承人？"布告张贴在巴黎城内，人们驻足观看。许多人读过以后，发自内心地说道：”法兰西现在和将来能够献给执政官的一切，永远低于他为法兰西所做的一切。“5月12日，选举活动开始。警察局秘书处、每个市政厅、每个法院书记室都摆上了两个登记簿。赞成拿破仑为终身执政的在一个簿上签名，反对的则在另一个簿上签名。警方人员混杂在选民当中，精心地搜集着选民的反应。可是，警探所听到的每一句话都是赞扬执政官的。
选举在兴高采烈的气氛中进行，反对者寥寥无几。最终选举结果不言而喻，但巴黎市民还是怀着某种激动心情等待公布最后结果。2个月后，统计结果出来了，3568885名法兰西公民赞成波拿巴荣任终身执政官，反对者仅8374人。人们沉浸在无比兴奋中，似乎法兰西命运会由此永恒地确定下来。
1802年8月2日，拿破仑终于被任命为终身执政。尽管许多效忠共和政体的将军，如卡尔诺、马塞纳、莫罗都投下了反对票，但那也无济于事了。
不久，拿破仑又向审议各种新法典的委员会表示赞成罗马法关于过继的规定，他说这样选定的嗣子比亲生儿子还要亲。人们十分清楚拿破仑是想过继一个他兄弟的儿子作嗣子，因为约瑟芬已无法为他生儿育女。1802年8月4日，保守的参议院以一项简单法令授权他用遗嘱证书的方式指定执政一职的继承人。现在连感觉最迟钝的人都已看清第一执政已大权在握，恢复帝制是迟早的事了。
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