所谓：“剥皮囊草”就是剥下人皮，用草填充之。朱元璋出身贫苦，讨过饭、当过和尚、打过杂役，深知百姓的疾苦，他对贪官污吏恨之入骨，自当上皇帝后，还专门为被判处枭首示众、凌迟处死的贪官设制了一种铁血手段“剥皮囊草”即，用贪官的人皮楦成草袋子，高悬于公堂之上，以示儆告。可见其整肃贪官的决心。当然，这种手段在今天看来太原始落后，也过于残酷和不人道。难道就没有更先进、更好的办法么？回答是肯定的，关键是领导人的决心和相应的措施和手段是否强硬。
朱元璋称帝后，便在全国范围内大量拉拢士大夫参加各级政权，洪武十九年（1386年），朱元璋选取应天各府、州、县士大夫到南京做官，共一千四百余人。洪武三十年（1399年），明政府调查浙江等九布政司，直隶、应天十八府州，田地在七百亩以上的地主，共一万四千余户，编成花名册，准备分批召见录用。
据有关资料，明朝政府的中央官制，在洪武初年，仍沿袭汉唐旧制。后来随着明太祖统治力量的逐步加强，洪武二十八年（公元1395年）六月，自己制定了一套新制度。明朝的官制大致分以下几类：
第一类，三公、三孤。三公：太师、太傅、太保（正一品）。三孤：少师、少傅、少保（从一品）；令有太子太师、太子太傅、太子太保（从一品）；太子少师、太子少傅、太子少保（正二品）。
第二类，六部。吏部、户部、礼部、兵部、刑部、工部（按顺序）六部各设尚书一人，直接对皇帝负责，尚书之下有左右侍郎（副部长）、郎中（司长）、主事等。吏部：负责官吏的管理，考核，升迁等户部：有十三个司，分别管理各地的收支与报销。礼部：主管国家凶吉大典，教育与考试，招待外宾，宴劳功臣等。兵部：管理天下军政（军令由五军都督府管理）；刑部：管理天下刑名。工部：管理建筑、后勤、水利、制造等。
第三类，督察院。直属于皇帝的监察部门下设左右督御史（正二品）、左右副督御史（正三品）、左右佥督御史（正四品）再往下设十三道监察御史，分管每个省的检查工作（当时中国分十三个省）十三道监察御史与直属于皇帝的六科给事中，统称“科道”属于言官范畴。
第四类，六科。分为吏、户、礼、兵、刑、工六科，每科设督给事中（正七品）、左右给事中与给事中（从七品）。给事中品级虽低，权利很大，皇帝交给各个衙门办理的工作由六科每五天注销一次，如果有脱拉或者办事不力的，六科可以向皇帝报告。六科还可以参与官员的选拔，皇帝御前会议，审理有罪的官员。最为重要的是六科有封还皇帝敕书的权利，皇帝的旨意如果六科认为不妥可以封还，不予执行。
第五类，五寺。五寺是五衙门的简称，包括大理寺、太常寺、光禄寺、太仆寺、鸿胪寺。大理寺，相当于今天的法院，是全国最高上诉机关。与督察院、刑部构成了三法司。太常寺，主管祭祀；光禄寺，主管宴享；太仆寺，管马；鸿胪寺，管招待外宾。
第六类，詹士府。詹士府是负责辅助太子的机构设正三品詹士一人，正四品少詹士一人，正六品府丞一人。詹士府设左右春坊，司经局，主簿厅。
第七类，太医院。太医院是管理宫廷及贵族诊断，制药的，设正五品院使一人，正六品院判二人，正八品御医四人，从九品吏目若干人。
第八类，翰林院。相当于现在国立大学、干部学院等的综合，翰林院的首长称为翰林学士（正五品），侍读学士两人，侍讲学士两人（从五品），侍读、侍讲各两人（正六品），修撰（从六品），考中状元后就会被授予此职位。编修（正七品），榜眼、探花考中后就会被授予此职位。
第九类，宦官机构。此外还有在都城的其他机构、卫所和五军都督府等，恕不赘述。
明初，朱元璋为了使江山永固，恢复了周代的分封制度，将自己的24个儿子和1个从孙封为亲王，分驻全国各战略要地，并且统领军队，以北方的九个边塞藩王统兵最多，燕王朱棣即为其一。由于藩王的权力过大，明太祖在世时，曾有言官上书，以晋八王之乱为例，指出太祖分封存在的隐患。但是太祖并不介意。至太祖暮年，诸王的兵权日盛，尤以燕王朱棣、宁王朱权为最，皇太孙朱允炆曾经忧虑，一旦祖父驾崩，自己如何来制约这些手握重兵的叔叔。明太祖死后只有四年，朱允炆政权就被四叔朱棣推翻，而且朱棣一上台，就消除了藩王的兵权，至明中叶之后，藩王只有虚号，而无实权。明史说这些藩王们“一旦盗起，无以御侮，徒手就戮”，这恰恰是朱元璋封建之初所不能预料的。
朱元璋创建明朝后勤奋治国三十一年，整肃吏治，严惩贪官，创立卫所，巩固边防，重视农业，对社会的稳定，国家的统一和发展,都起了积极作用。朱元璋胸怀韬略，深谋远虑，善于驾驭战争，掌握主动权。在群雄对峙中，巧择战机，各个击破。每战持重用兵，力避两面受敌，并适时集中兵力歼灭敌人。注重招贤纳士，广采众议，严格治军，完善军制，练兵育将，强调将领要识、谋、仁、勇兼备。主张寓兵于农，且耕且战，保持一支强大的武装力量，其军事思想对后世有较大影响。
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