纳戈尔诺—卡拉巴赫问题依然支配着亚美尼亚和阿塞拜疆的政治生活。阿塞拜疆总统阿亚兹·穆塔利博夫可能希望在这一斗争中得到莫斯科的更多支持，因而最初赞成政变企图，但当政变流产后，他支持宣布独立，以免自己遭到莫斯科的惩罚。他的突然转变，以及他未能按照阿塞拜疆的条件解决有关卡拉巴赫的争端，削弱了他的地位，并使他易于遭到阿塞拜疆国民阵线的攻击，1月份，苏联军队镇压了阿塞拜疆国民阵线，但它的力量现在重新集结起来。此外，穆塔利博夫还要同海达尔·阿利耶夫进行竞争，阿利耶夫曾经是勃列日涅夫时期的政治局委员，在戈尔巴乔夫上台不久就被排挤出去，后以他的家乡纳希切万为基地重新确立了其地位，纳希切万是位于亚美尼亚和土耳其之间的阿塞拜疆飞地。
与此相反，亚美尼亚保持着国内的政治稳定。列翁·捷尔-彼得罗相于1990年当选为最高苏维埃主席，他正领导着国家有秩序地脱离苏联，他在政变刚刚发生就表示坚决反对政变。然而，该国在运输问题上经受着长期的联合抵制，承受着从1989年地震灾害后重建家园和进行对阿塞拜疆的未宣布的战争的双重负担，经济上一片混乱。它的未来将继续陷于有关卡拉巴赫的冲突中。
中亚各共和国对莫斯科所发生的戏剧性事件的反应差异最大。无论是哈萨克斯坦的努尔苏丹·纳扎尔巴耶夫，还是吉尔吉斯斯坦的阿斯卡尔·阿卡耶夫，都在政变刚发生时就对它加以谴责，随后，阿卡耶夫支持宣布独立。与此相反，纳扎尔巴耶夫仍对戈尔巴乔夫保持忠诚，并且实际上是为签订联盟条约，重组联盟或邦联而努力的最后一位共和国领导人。
南方的三个共和国仍处于旧的共产党机器的控制之下，它们对政变曾持欢迎或者默认的态度。政变流产后，它们宣告独立，以免被莫斯科吹来的自由主义浪潮所波及。乌兹别克斯坦总统伊斯兰姆·卡里莫夫和土库曼斯坦总统萨帕尔穆拉德·尼亚佐夫还由此加强了对权力的控制，并开始对抗在改革运动中成长起来的民主反对派，在乌兹别克斯坦，尽管一直有压力，民主反对派仍获得了巨大的发展，但在土库曼斯坦，民主反对派的发展微不足道，对莫斯科试图建立的更自由的标准，它从未保持一致。
从常规经济指标来看，塔吉克斯坦是各共和国中最穷的一个，它也陷入到政治冲突之中。该国有一个持民族主义思想的知识分子所领导的民主反对派，他们强迫当地共产党领导人卡哈尔·马赫卡莫夫辞职，因为他曾支持政变。然而，他们对共产党政治机器的胜利为时很短。马赫卡莫夫的继任人卡德林金·阿斯洛诺夫上台后立即取缔了共产党，但共产党改名为社会党，由共产党所控制的立法机构否决了禁党令，并帮助马赫卡莫夫的前任拉赫曼·纳比耶夫重新掌权，纳比耶夫是在1985年被戈尔巴乔夫撤职的。在随后进行的总统选举中，纳比耶夫取得了胜利，但是外国观察家发现了广泛作弊的证据。
结果，“民主派”开始同两个穆斯林派反对党联合起来，国家处于内战的边缘，由于穆斯林集团得到了阿富汗穆贾迪迪派的支持，局势更加险恶，穆贾迪迪在战胜了苏联所支持的喀布尔政权后，有多余的武器可提供给边界那边的朋友。
苏联的转变
莫斯科不愿卷入这些地方斗争，尽管叶利钦曾同纳扎尔巴耶夫一起到纳戈尔诺—卡拉巴赫作短期停留，试图调解那里的冲突。首都的注意力集中在试图支撑风雨飘摇的苏联政府，稳固地扩展俄罗斯政府的有效管辖范围，以及为签订新的联盟条约而进行的狂热谈判等等问题上。
9月第一周，苏联人民代表大会召开特别会议，讨论因流产政变而引起的问题，经过激烈的辩论，以压倒多数票通过了建立“主权国家联盟”的议案，满足了参加新国务会议第一次会议的10个共和国领导人的要求。人们认为，这意味着人民代表大会制的终结。
虽然某些人认为在几周内将签订联盟条约，因为反对建立松散联盟的派别已经崩溃，但苏联人民代表大会还是建立了一个新的苏联政府组织，它将维持到新的联盟条约或新的宪法生效。其主要机构为：国务会议，它由那些希望签署联盟条约的共和国总统组成，苏联总统任主席；经过重组的最高苏维埃，协调各共和国之间经济政策的跨国经济委员会。然而，企业的主要管理权将移交给各共和国，实际上，各共和国已经宣布控制位于其领土内的国家财产。
辩论极为激烈，因为多数代表并不愿意投票通过设立现存机构之外的新机构。他们最终被收买了，保证让他们享有现在的工资和特权直到1994年底其最初的任期届满为止。
尽管许多人认为，匆忙设计的新的国家结构只能维持很短的过渡时期，但如果在更顺利的环境下，它所包含的某些妥协折衷，本来能够使它解决在8月份之前拖延了联盟条约谈判的某些争论。例如，作为立法机构的上议院，拥有对下议院所通过法律的否决权，其组成成员为：每个参加联盟的共和国各出20名代表，再加上每个前自治共和国各出一名代表。由于多数前自治共和国位于俄罗斯境内，这一规定给予俄罗斯比其他共和国更多的席位。然而，每个共和国在上议院只有一票表决权，因此，额外的代表只不过给俄罗斯提供了更大的声音，而不是更多的票数。
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