这是第二种说法的结论，但不管今人我们持哪一种说法，有一点是毋庸置疑的，李自成在北京杀死了吴三桂所有的家人，同样的也把他自己和吴三桂共同的逼上了绝路。
李自成不是楚霸王，这一点也是毋庸置疑的，楚霸王虽无帝王之才，但还有英雄之德。李自成到了这个时候，不但不是英雄，甚至沦为了下九流的盗匪。他此时做出的这个极不理智的决定，完全出于泄个人私愤，已经没有一点理性的成分存在了。这个事情，皇太极是永远不会做的，当年祖大寿借假投降之机袭击皇太极，使清军损失惨重，后来皇太极劫掠其家人，始终礼待有加，终于感动的祖大寿弃城投降。这份胸怀与气度，与李自成、崇祯之流相比，有天壤云泥之别，如今，李自成的这个做法，是更进一步帮助多尔衮借助汉人消灭自己，加速了自己的灭亡之路。
而这一场大战的结果是，吴三桂赢了，但他赔上了全家人的性命。
没有历史资料证明吴三桂对此的反应是怎样的，也许他心里在哭泣吧，但是他的脸上已经麻木，没有了泪，只有眼中的寒光，令人心悸而恐惧。从那天起，吴三桂变成了一头猛兽，他的攻势就越来越猛，对李自成穷追猛打直至其身死，而这些战斗中他始终没有输过一仗，吴三桂成了李自成梦中的恶魔，他们之间的仇恨再也难以弥合。
而在这一场大屠杀中，陈圆圆却幸免于难了。
此时的陈圆圆，就在李自成的宫中，这位让吴大将军冲冠一怒的人物，竟然与世隔绝般的苟活于敌人的阵营里，也算一件奇事。吴三桂的到来给她恐惧的生活带来极大的希望，但是，她也知道，在暴怒的李自成面前，自己随时会成为刀下鬼，于是，当她得知了吴襄被杀后，这个外表极为孱弱的女子却表现出了极为稳定的心理状态和智谋，她劝说李自成不要杀死自己，并让自己随军前行，理由是自己可以成为挟制吴三桂的一张救命牌，李自成答应了她的要求。也许面对如此美女，他也下不了手吧，陈圆圆竟然在这个极为危险的时刻，用自己的智慧保住了自己的性命。这也说明，除了美貌，她身上更有许多难得的品质。
在一片惶恐的情绪下，李自成登基了。一个月前，崇祯在这里上了吊，一个月后，紫禁城迎来了新的皇帝李自成，四月二十九日，李自成在武英殿登极，一天后，这位皇帝下的第一道诏令就是马上撤出北京。
而这时，一种挫败感让这个只做了一天皇帝、曾以宽厚闻名天下的李闯王变得性情大变，他开始再次允许军士在北京城内杀人放火，以做最后的疯狂。牛金星揣摸其意，又出了一个极馊的主意：“大内（指皇宫）金银搜刮已尽，但皇居壮丽，焉肯弃掷他人！不如付之一炬，以作咸阳故事（指西楚霸王项羽焚咸阳）。即使后世议我辈者，亦不失为楚霸王之英豪。”（《明季北略》）
这位牛金星，与清室中的洪承畴、范文程相比，实乃混蛋之极的人物，他出的这个主意，令北京城再次遭受浩劫，也令李自成不但成不了楚霸王的英豪，反而在失败之路走得更快了。李自成应允了他的要求，接着，发出通告，令百姓出城。夜里十时，开始放火，一把大火，烧光了北京的富丽皇宫，宫城九门雉楼及大部分宫殿笼罩在火海之中。城外草场也被点燃，东交民巷一带的民居也被殃及，火光熊熊中，听得人声鼎沸，马声嘶鸣，北京城内，一片混乱。
这就是流民作乱的特点，一旦事败，往往以破坏作为泄愤的手段，这既是一种愤怒的情绪，也是一种无能的宣泄，只是苦了京城的百姓，短短数月间，几次遭遇了大的动乱。
这天的凌晨，在宫中大火的熊熊燃烧中，李自成逃出齐化门，刘宗敏等继其后，撤出北京，在齐化门外，竟又遭到了吴三桂军队的伏击，死伤无数。但李自成等人还是安全逃出了北京这个伤心地。李自成由入京到离京，只有四十一天时间，但在这四十一天中，北京人却觉得世界整个都要颠倒过来了。
北京城内，明朝前臣们欢呼雀跃，他们等待心目中的大英雄吴三桂到来，城门大开，一队军马进来，但这些人却不是吴三桂，而是多尔衮，清军占领了北京城，并在以后的几百年时间里一直成为北京的新主人。
大清算
吴三桂并没有赢得这场战争，他得了一个平西王的尊号，但是，北京一战，他失去了全家人的性命，也并没有得到陈圆圆，而最惨的是，他并不能进入北京，享受那帝国英雄的殊荣。
就在李自成逃走之后，多尔衮立刻下了一道命令，命吴三桂继续带兵追踪，而进入北京城的工作，则由他来完成了。
多尔衮不让吴三桂进城，其目的非常明显，北京的新主人，从此是大清的了，吴三桂想在北京重新拥立大明太子为皇帝，这当然不是他愿意看到的事情。吴三桂何许人也，在大明遗臣眼里他是英雄，在大清皇帝眼们，他不过是一降将而已，所以，真正有资格接管北京的人，是他多尔衮而绝不是吴三桂。
多尔衮不是李自成，他当然知道，北京对中原百姓意味着什么，这是中枢也是心脏，中枢一断、心脏一停，无论是大明还是大顺，命脉就全断了。
吴三桂来之前，已经发下公告，要求京城百姓做好迎接太朱慈烺子的准备，摆香案、穿素衣，为崇祯发丧。然后再立太子为新君。前明旧官也都纷纷出来维持社会秩序，在朝阳门预备法驾，迎接太子朱慈烺。但是当多尔衮一进关时，所有的人都大失所望，“臣民相顾失色”，多尔衮所辖满洲正白旗兵已大步流星的入了城，满城尽插白旗。
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