就王文韶、鹿传霖来讲，既然要求新科翰林入大学堂肄业，则王文韶主张掌院学士入学堂，督饬翰林用功，也就并非毫无理据。进言之，令翰林入大学堂肄业，意在以学堂“实学”补科举空疏之偏，调和科举、学堂的同时，实含抑科举而扬学堂的意蕴。考虑到王、鹿二人，尤其是王，是枢臣中力挺科举者，[58]则王此举实有深意存焉。这实际上涉及翰林院与大学堂，亦即科举与学堂的竞争关系问题。在改科举、兴学堂的新政时代，科举业已改章，翰林亦须用功实学，而今更须入大学堂再做学生。面对学堂咄咄逼人之势，王文韶主张派掌院入大学堂，就不无“反制”的意味。瞿鸿禨当然对此一目了然，不惜造膝密陈，寻求慈禧的支持，力避掌院入学堂、事事掣肘的局面出现。
中枢议政讲究保密，讨论未必留有记录，外人往往难得其详。幸运的是，张缉光致瞿鸿禨的两通密信，可以进一步揭示政务处“变通新进士章程”的形成过程及命意所在；而当日政务处大臣争论的内幕，直接涉及科举与学堂、翰林院与大学堂的纠葛，关系甚重，也可从第二通密信中得窥梗概。
从第一通信首先可知，瞿鸿禨命张缉光拟稿，张即据庶常馆旧制及仕学馆章程，并发挥东西各国强迫教育制度之旨，连缀成稿。首先，他说：“承谕拟稿，谨就愚见，敷析成篇，录呈钧采。篇中胪列旧制及语及仕学馆章程处，但凭记忆，无书可查，必有讹误。但缉光私见，窃以东西各国皆制为强迫教育制度”，即“国家以权力勒令士民就学，如英、德、日本各国，凡生子至六岁以上不入学堂者，罚其父母，凡民年二十未受普通教育者，不能享有国民权利，皆其强迫制度也”。张缉光认为瞿鸿禨“筹及此举”，令新进士入大学堂学习“新学”，考试合格方能毕业，“极得强迫之微意”。故张在稿中本强迫教育之旨“而隐其词”，以免“为流俗所骇”。其次，可知动议之初，本欲取消新进士分发中的内阁中书一途，改为分部主事，只是考虑到“现当诸事掣肘之时，更张太多，或反予人以口实。且变法不惟其名，惟其实，姑存其目，亦自无妨”，始作罢论。再次，在张缉光看来，经此改制，新进士须再做学生，科举将进一步式微，如果能“扩充此意而实行之”，则学堂教育将有勃兴之望。最后，虽然张缉光也不忘参加科考，且本年秋天刚刚中式顺天乡试举人，[59]但他倾向于废科举。他说：“至科举之废，万口同辞，故篇末揭明斯旨。”之所以如此，是因为变通新进士章程虽抑科举而扬学堂，但调和二者的痕迹甚显，张缉光担心倘不揭明废科举之旨，“恐人疑此奏为保护科举而设”，则瞿鸿禨抑科举而扬学堂的深意将不为世人所谅，甚至会遭到主废科举的趋新舆论的责难。有意思的是，张缉光在信尾，以王安石变法“三不足”的口吻耸动瞿鸿禨道：“同僚之论不足凭，天下之评最可贵，尚冀坚持此说而终成之，于人才大有造也。”[60]
可以想见，瞿鸿禨收到张缉光的稿子后，定有修改。比如明言废科举，想必瞿此时亦未必以为然，[61]更不大可能贸然拿给王文韶、鹿传霖去商酌，因为王坚决反对废科举的立场，瞿了然于胸。当稿子在政务处层面讨论时，王文韶提出了两点修改意见：一是翰林院掌院学士入大学堂；二是新科翰林的教习必须是翰林、进士出身人员。张缉光得知此情后，愤激难掩，再次上书瞿鸿禨，痛切直言：
日前谕及之件，闻相臣颇有异议，欲以掌院插入学堂，而翰林必以进士、翰林为教习。窃怪旧见之难化，而不计事之无益，竟若此耶。国家于科举改试策论，是明明谓八股不如策论，今欲以八股之旧翰林、进士，教明年策论所得之新翰林、进士，似于变法初意太相矛盾（今大学堂教习，非无翰林、进士，亦适成为中国人才耳）。且翰林、进士之待教习者，教以新学也，其人果有学，自足教人，何必以至不足重之科名限之。且今中国之大，绝非无（原文如此——引者注）配充教习之人，盖现今人才，皆以八股出身，于科学一无所知，欲求实在办法，非尽聘洋教习不可，其次亦非以游学生为教习不可。盖所贵乎学堂者，学我所本无之学，高谈经史无益也。
至掌院一节，不惟无益，反生出无穷牵掣、无穷阻难。为掌院者，果由学堂出身，果非以八股得科名则可，否则八股旧见适足以为学堂之蟊贼，不独所教之翰林、进士无效，即现设之仕学馆亦必为所牵动。此事甚有关系，惟详虑之。议者果爱翰林为饩羊，视科举为命脉，则仕学之说可作罢论。即欲敷衍，可令翰林院设置仕学馆，以掌院为总教习，又选派数老翰林为分教习，与大学堂之仕学馆分道扬镳可也。变法而不得法，不如不变之为愈。前闻尊议一出，管学告知学堂人士，皆极称颂，谓不如竟废科举之痛快，而能使天下之心目注重学堂，科举必难久立于世界，为功不小。
今若此，则八股掌院侈然有干预新学之权，而教习尤必以科名为重。是非重学也，重科名也。且亦必不能有成效，亦故作风波，取人笑骂而已。此事外间已知吾师主持，或得或失，不免集论于吾师。似不如坚持前见，以拯陷溺，否则竟作罢论，犹免讥嘲。……弟子非敢谓八股翰林无明通之才，但止足以言明通，不可以言实学。教习但取其学，若以科名为招，则夤缘自荐者何以御之。[62]
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